Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEFF2Q9UIK5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEFF2Q9UIK5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEFF2Q9UIK5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEFF2Q9UIK5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEFF2Q9UIK5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEFF2Q9UIK5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEFF2Q9UIK5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEFF2Q9UIK5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEFF2Q9UIK5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEFF2Q9UIK5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEFF2Q9UIK5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEFF2Q9UIK5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMEFF2Q9UIK5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEFF2Q9UIK5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEFF2Q9UIK5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEFF2Q9UIK5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEFF2Q9UIK5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEFF2Q9UIK5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEFF2Q9UIK5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEFF2Q9UIK5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEFF2Q9UIK5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEFF2Q9UIK5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEFF2Q9UIK5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEFF2Q9UIK5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEFF2Q9UIK5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEFF2Q9UIK5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEFF2Q9UIK5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEFF2Q9UIK5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEFF2Q9UIK5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEFF2Q9UIK5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEFF2Q9UIK5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEFF2Q9UIK5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEFF2Q9UIK5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEFF2Q9UIK5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEFF2Q9UIK5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEFF2Q9UIK5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEFF2Q9UIK5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEFF2Q9UIK5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEFF2Q9UIK5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEFF2Q9UIK5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEFF2Q9UIK5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEFF2Q9UIK5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEFF2Q9UIK5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEFF2Q9UIK5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEFF2Q9UIK5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEFF2Q9UIK5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEFF2Q9UIK5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEFF2Q9UIK5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEFF2Q9UIK5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEFF2Q9UIK5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEFF2Q9UIK5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEFF2Q9UIK5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEFF2Q9UIK5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEFF2Q9UIK5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEFF2Q9UIK5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEFF2Q9UIK5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEFF2Q9UIK5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEFF2Q9UIK5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEFF2Q9UIK5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEFF2Q9UIK5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEFF2Q9UIK5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEFF2Q9UIK5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEFF2Q9UIK5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEFF2Q9UIK5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEFF2Q9UIK5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEFF2Q9UIK5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEFF2Q9UIK5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEFF2Q9UIK5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEFF2Q9UIK5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEFF2Q9UIK5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEFF2Q9UIK5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEFF2Q9UIK5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEFF2Q9UIK5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEFF2Q9UIK5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEFF2Q9UIK5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEFF2Q9UIK5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEFF2Q9UIK5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEFF2Q9UIK5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEFF2Q9UIK5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEFF2Q9UIK5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEFF2Q9UIK5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEFF2Q9UIK5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEFF2Q9UIK5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEFF2Q9UIK5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEFF2Q9UIK5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMEFF2Q9UIK5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMEFF2Q9UIK5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEFF2Q9UIK5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEFF2Q9UIK5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEFF2Q9UIK5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEFF2Q9UIK5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEFF2Q9UIK5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEFF2Q9UIK5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEFF2Q9UIK5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEFF2Q9UIK5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEFF2Q9UIK5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEFF2Q9UIK5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEFF2Q9UIK5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEFF2Q9UIK5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms