Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY5

LPAR3, Lysophosphatidic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR3Q9UBY5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LPAR3Q9UBY5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPAR3Q9UBY5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPAR3Q9UBY5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPAR3Q9UBY5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPAR3Q9UBY5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPAR3Q9UBY5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPAR3Q9UBY5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPAR3Q9UBY5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPAR3Q9UBY5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPAR3Q9UBY5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPAR3Q9UBY5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPAR3Q9UBY5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LPAR3Q9UBY5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPAR3Q9UBY5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPAR3Q9UBY5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPAR3Q9UBY5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPAR3Q9UBY5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPAR3Q9UBY5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPAR3Q9UBY5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPAR3Q9UBY5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LPAR3Q9UBY5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LPAR3Q9UBY5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LPAR3Q9UBY5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LPAR3Q9UBY5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LPAR3Q9UBY5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPAR3Q9UBY5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPAR3Q9UBY5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPAR3Q9UBY5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPAR3Q9UBY5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPAR3Q9UBY5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPAR3Q9UBY5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LPAR3Q9UBY5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LPAR3Q9UBY5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LPAR3Q9UBY5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LPAR3Q9UBY5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LPAR3Q9UBY5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPAR3Q9UBY5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPAR3Q9UBY5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPAR3Q9UBY5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPAR3Q9UBY5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPAR3Q9UBY5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPAR3Q9UBY5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LPAR3Q9UBY5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPAR3Q9UBY5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPAR3Q9UBY5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPAR3Q9UBY5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LPAR3Q9UBY5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPAR3Q9UBY5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPAR3Q9UBY5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPAR3Q9UBY5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPAR3Q9UBY5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPAR3Q9UBY5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LPAR3Q9UBY5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPAR3Q9UBY5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPAR3Q9UBY5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPAR3Q9UBY5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPAR3Q9UBY5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPAR3Q9UBY5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPAR3Q9UBY5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LPAR3Q9UBY5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPAR3Q9UBY5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LPAR3Q9UBY5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPAR3Q9UBY5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPAR3Q9UBY5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPAR3Q9UBY5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LPAR3Q9UBY5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPAR3Q9UBY5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPAR3Q9UBY5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LPAR3Q9UBY5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LPAR3Q9UBY5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LPAR3Q9UBY5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPAR3Q9UBY5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPAR3Q9UBY5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPAR3Q9UBY5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPAR3Q9UBY5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPAR3Q9UBY5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LPAR3Q9UBY5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPAR3Q9UBY5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LPAR3Q9UBY5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LPAR3Q9UBY5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPAR3Q9UBY5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPAR3Q9UBY5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPAR3Q9UBY5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPAR3Q9UBY5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LPAR3Q9UBY5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPAR3Q9UBY5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPAR3Q9UBY5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPAR3Q9UBY5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LPAR3Q9UBY5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LPAR3Q9UBY5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LPAR3Q9UBY5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LPAR3Q9UBY5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LPAR3Q9UBY5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LPAR3Q9UBY5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LPAR3Q9UBY5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LPAR3Q9UBY5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LPAR3Q9UBY5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LPAR3Q9UBY5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPAR3Q9UBY5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms