Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPB1Q9UBR1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPB1Q9UBR1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
UPB1Q9UBR1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPB1Q9UBR1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPB1Q9UBR1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPB1Q9UBR1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPB1Q9UBR1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPB1Q9UBR1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPB1Q9UBR1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UPB1Q9UBR1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPB1Q9UBR1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPB1Q9UBR1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPB1Q9UBR1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPB1Q9UBR1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UPB1Q9UBR1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPB1Q9UBR1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPB1Q9UBR1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPB1Q9UBR1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UPB1Q9UBR1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UPB1Q9UBR1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UPB1Q9UBR1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UPB1Q9UBR1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UPB1Q9UBR1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UPB1Q9UBR1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UPB1Q9UBR1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPB1Q9UBR1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPB1Q9UBR1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPB1Q9UBR1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UPB1Q9UBR1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UPB1Q9UBR1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UPB1Q9UBR1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPB1Q9UBR1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPB1Q9UBR1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPB1Q9UBR1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPB1Q9UBR1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPB1Q9UBR1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPB1Q9UBR1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPB1Q9UBR1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPB1Q9UBR1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPB1Q9UBR1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPB1Q9UBR1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPB1Q9UBR1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPB1Q9UBR1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPB1Q9UBR1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPB1Q9UBR1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPB1Q9UBR1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPB1Q9UBR1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPB1Q9UBR1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPB1Q9UBR1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPB1Q9UBR1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPB1Q9UBR1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPB1Q9UBR1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPB1Q9UBR1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UPB1Q9UBR1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UPB1Q9UBR1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UPB1Q9UBR1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UPB1Q9UBR1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
UPB1Q9UBR1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UPB1Q9UBR1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UPB1Q9UBR1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UPB1Q9UBR1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPB1Q9UBR1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPB1Q9UBR1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UPB1Q9UBR1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPB1Q9UBR1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPB1Q9UBR1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPB1Q9UBR1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPB1Q9UBR1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UPB1Q9UBR1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPB1Q9UBR1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPB1Q9UBR1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPB1Q9UBR1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPB1Q9UBR1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPB1Q9UBR1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPB1Q9UBR1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPB1Q9UBR1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPB1Q9UBR1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPB1Q9UBR1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPB1Q9UBR1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPB1Q9UBR1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPB1Q9UBR1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPB1Q9UBR1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPB1Q9UBR1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPB1Q9UBR1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UPB1Q9UBR1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UPB1Q9UBR1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UPB1Q9UBR1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPB1Q9UBR1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPB1Q9UBR1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPB1Q9UBR1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPB1Q9UBR1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPB1Q9UBR1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UPB1Q9UBR1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UPB1Q9UBR1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
UPB1Q9UBR1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPB1Q9UBR1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPB1Q9UBR1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPB1Q9UBR1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPB1Q9UBR1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms