Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATXN10Q9UBB4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATXN10Q9UBB4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ATXN10Q9UBB4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATXN10Q9UBB4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATXN10Q9UBB4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATXN10Q9UBB4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATXN10Q9UBB4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATXN10Q9UBB4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATXN10Q9UBB4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATXN10Q9UBB4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATXN10Q9UBB4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATXN10Q9UBB4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ATXN10Q9UBB4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATXN10Q9UBB4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATXN10Q9UBB4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATXN10Q9UBB4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATXN10Q9UBB4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATXN10Q9UBB4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ATXN10Q9UBB4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATXN10Q9UBB4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATXN10Q9UBB4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATXN10Q9UBB4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATXN10Q9UBB4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATXN10Q9UBB4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATXN10Q9UBB4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATXN10Q9UBB4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATXN10Q9UBB4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATXN10Q9UBB4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATXN10Q9UBB4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATXN10Q9UBB4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATXN10Q9UBB4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATXN10Q9UBB4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATXN10Q9UBB4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATXN10Q9UBB4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATXN10Q9UBB4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATXN10Q9UBB4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATXN10Q9UBB4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATXN10Q9UBB4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATXN10Q9UBB4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATXN10Q9UBB4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ATXN10Q9UBB4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATXN10Q9UBB4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATXN10Q9UBB4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATXN10Q9UBB4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATXN10Q9UBB4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATXN10Q9UBB4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATXN10Q9UBB4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATXN10Q9UBB4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATXN10Q9UBB4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATXN10Q9UBB4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATXN10Q9UBB4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATXN10Q9UBB4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATXN10Q9UBB4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATXN10Q9UBB4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATXN10Q9UBB4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATXN10Q9UBB4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATXN10Q9UBB4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATXN10Q9UBB4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATXN10Q9UBB4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATXN10Q9UBB4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATXN10Q9UBB4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATXN10Q9UBB4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATXN10Q9UBB4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATXN10Q9UBB4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATXN10Q9UBB4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ATXN10Q9UBB4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATXN10Q9UBB4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATXN10Q9UBB4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATXN10Q9UBB4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATXN10Q9UBB4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATXN10Q9UBB4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATXN10Q9UBB4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATXN10Q9UBB4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATXN10Q9UBB4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATXN10Q9UBB4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATXN10Q9UBB4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATXN10Q9UBB4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATXN10Q9UBB4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATXN10Q9UBB4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATXN10Q9UBB4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATXN10Q9UBB4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATXN10Q9UBB4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATXN10Q9UBB4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATXN10Q9UBB4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATXN10Q9UBB4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATXN10Q9UBB4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATXN10Q9UBB4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATXN10Q9UBB4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATXN10Q9UBB4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATXN10Q9UBB4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATXN10Q9UBB4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATXN10Q9UBB4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATXN10Q9UBB4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATXN10Q9UBB4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATXN10Q9UBB4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATXN10Q9UBB4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATXN10Q9UBB4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATXN10Q9UBB4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATXN10Q9UBB4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms