Protein–RNA interactions for Protein: Q9P013

CWC15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC15Q9P013 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CWC15Q9P013 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CWC15Q9P013 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CWC15Q9P013 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CWC15Q9P013 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CWC15Q9P013 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CWC15Q9P013 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CWC15Q9P013 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CWC15Q9P013 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CWC15Q9P013 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CWC15Q9P013 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CWC15Q9P013 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CWC15Q9P013 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CWC15Q9P013 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CWC15Q9P013 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CWC15Q9P013 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CWC15Q9P013 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CWC15Q9P013 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CWC15Q9P013 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CWC15Q9P013 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CWC15Q9P013 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CWC15Q9P013 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CWC15Q9P013 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CWC15Q9P013 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CWC15Q9P013 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CWC15Q9P013 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CWC15Q9P013 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CWC15Q9P013 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CWC15Q9P013 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CWC15Q9P013 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CWC15Q9P013 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CWC15Q9P013 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CWC15Q9P013 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CWC15Q9P013 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CWC15Q9P013 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CWC15Q9P013 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CWC15Q9P013 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CWC15Q9P013 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CWC15Q9P013 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CWC15Q9P013 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CWC15Q9P013 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CWC15Q9P013 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CWC15Q9P013 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CWC15Q9P013 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CWC15Q9P013 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CWC15Q9P013 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CWC15Q9P013 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CWC15Q9P013 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CWC15Q9P013 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CWC15Q9P013 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CWC15Q9P013 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CWC15Q9P013 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CWC15Q9P013 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CWC15Q9P013 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CWC15Q9P013 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CWC15Q9P013 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CWC15Q9P013 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CWC15Q9P013 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CWC15Q9P013 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CWC15Q9P013 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CWC15Q9P013 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CWC15Q9P013 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CWC15Q9P013 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CWC15Q9P013 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CWC15Q9P013 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CWC15Q9P013 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CWC15Q9P013 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CWC15Q9P013 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CWC15Q9P013 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CWC15Q9P013 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CWC15Q9P013 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CWC15Q9P013 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CWC15Q9P013 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CWC15Q9P013 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CWC15Q9P013 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CWC15Q9P013 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CWC15Q9P013 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CWC15Q9P013 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CWC15Q9P013 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CWC15Q9P013 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CWC15Q9P013 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CWC15Q9P013 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CWC15Q9P013 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CWC15Q9P013 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CWC15Q9P013 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CWC15Q9P013 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CWC15Q9P013 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CWC15Q9P013 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CWC15Q9P013 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CWC15Q9P013 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CWC15Q9P013 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CWC15Q9P013 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CWC15Q9P013 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CWC15Q9P013 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CWC15Q9P013 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CWC15Q9P013 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CWC15Q9P013 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CWC15Q9P013 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CWC15Q9P013 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CWC15Q9P013 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms