Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TMOD3Q9NYL9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
TMOD3Q9NYL9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
TMOD3Q9NYL9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
TMOD3Q9NYL9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
TMOD3Q9NYL9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TMOD3Q9NYL9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TMOD3Q9NYL9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
TMOD3Q9NYL9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
TMOD3Q9NYL9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TMOD3Q9NYL9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TMOD3Q9NYL9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TMOD3Q9NYL9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TMOD3Q9NYL9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
TMOD3Q9NYL9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
TMOD3Q9NYL9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TMOD3Q9NYL9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TMOD3Q9NYL9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
TMOD3Q9NYL9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
TMOD3Q9NYL9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TMOD3Q9NYL9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
TMOD3Q9NYL9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
TMOD3Q9NYL9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TMOD3Q9NYL9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
TMOD3Q9NYL9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TMOD3Q9NYL9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TMOD3Q9NYL9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TMOD3Q9NYL9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TMOD3Q9NYL9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TMOD3Q9NYL9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TMOD3Q9NYL9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
TMOD3Q9NYL9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TMOD3Q9NYL9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TMOD3Q9NYL9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TMOD3Q9NYL9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TMOD3Q9NYL9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TMOD3Q9NYL9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TMOD3Q9NYL9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TMOD3Q9NYL9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
TMOD3Q9NYL9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
TMOD3Q9NYL9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TMOD3Q9NYL9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
TMOD3Q9NYL9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
TMOD3Q9NYL9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
TMOD3Q9NYL9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
TMOD3Q9NYL9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TMOD3Q9NYL9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
TMOD3Q9NYL9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TMOD3Q9NYL9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TMOD3Q9NYL9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TMOD3Q9NYL9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TMOD3Q9NYL9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TMOD3Q9NYL9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TMOD3Q9NYL9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
TMOD3Q9NYL9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TMOD3Q9NYL9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TMOD3Q9NYL9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
TMOD3Q9NYL9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
TMOD3Q9NYL9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
TMOD3Q9NYL9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TMOD3Q9NYL9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TMOD3Q9NYL9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TMOD3Q9NYL9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TMOD3Q9NYL9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TMOD3Q9NYL9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TMOD3Q9NYL9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TMOD3Q9NYL9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TMOD3Q9NYL9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TMOD3Q9NYL9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
TMOD3Q9NYL9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TMOD3Q9NYL9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
TMOD3Q9NYL9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TMOD3Q9NYL9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TMOD3Q9NYL9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TMOD3Q9NYL9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
TMOD3Q9NYL9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TMOD3Q9NYL9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TMOD3Q9NYL9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TMOD3Q9NYL9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TMOD3Q9NYL9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
TMOD3Q9NYL9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
TMOD3Q9NYL9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
TMOD3Q9NYL9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TMOD3Q9NYL9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TMOD3Q9NYL9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TMOD3Q9NYL9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TMOD3Q9NYL9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TMOD3Q9NYL9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TMOD3Q9NYL9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TMOD3Q9NYL9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TMOD3Q9NYL9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.48
TMOD3Q9NYL9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TMOD3Q9NYL9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TMOD3Q9NYL9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
TMOD3Q9NYL9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TMOD3Q9NYL9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TMOD3Q9NYL9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
TMOD3Q9NYL9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TMOD3Q9NYL9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
TMOD3Q9NYL9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms