Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCF3Q9NUQ8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCF3Q9NUQ8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCF3Q9NUQ8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCF3Q9NUQ8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCF3Q9NUQ8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCF3Q9NUQ8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCF3Q9NUQ8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCF3Q9NUQ8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCF3Q9NUQ8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCF3Q9NUQ8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCF3Q9NUQ8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCF3Q9NUQ8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCF3Q9NUQ8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCF3Q9NUQ8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCF3Q9NUQ8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCF3Q9NUQ8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCF3Q9NUQ8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCF3Q9NUQ8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCF3Q9NUQ8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCF3Q9NUQ8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCF3Q9NUQ8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCF3Q9NUQ8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCF3Q9NUQ8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCF3Q9NUQ8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCF3Q9NUQ8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCF3Q9NUQ8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCF3Q9NUQ8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCF3Q9NUQ8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCF3Q9NUQ8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCF3Q9NUQ8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCF3Q9NUQ8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCF3Q9NUQ8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCF3Q9NUQ8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCF3Q9NUQ8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCF3Q9NUQ8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCF3Q9NUQ8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCF3Q9NUQ8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCF3Q9NUQ8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCF3Q9NUQ8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCF3Q9NUQ8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCF3Q9NUQ8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCF3Q9NUQ8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCF3Q9NUQ8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCF3Q9NUQ8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCF3Q9NUQ8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCF3Q9NUQ8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCF3Q9NUQ8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ABCF3Q9NUQ8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCF3Q9NUQ8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCF3Q9NUQ8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCF3Q9NUQ8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCF3Q9NUQ8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCF3Q9NUQ8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCF3Q9NUQ8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCF3Q9NUQ8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCF3Q9NUQ8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCF3Q9NUQ8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCF3Q9NUQ8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCF3Q9NUQ8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCF3Q9NUQ8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCF3Q9NUQ8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCF3Q9NUQ8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCF3Q9NUQ8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCF3Q9NUQ8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCF3Q9NUQ8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCF3Q9NUQ8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCF3Q9NUQ8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCF3Q9NUQ8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCF3Q9NUQ8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCF3Q9NUQ8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCF3Q9NUQ8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCF3Q9NUQ8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCF3Q9NUQ8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCF3Q9NUQ8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCF3Q9NUQ8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCF3Q9NUQ8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCF3Q9NUQ8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCF3Q9NUQ8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCF3Q9NUQ8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCF3Q9NUQ8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCF3Q9NUQ8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCF3Q9NUQ8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCF3Q9NUQ8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCF3Q9NUQ8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCF3Q9NUQ8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCF3Q9NUQ8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCF3Q9NUQ8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCF3Q9NUQ8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCF3Q9NUQ8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCF3Q9NUQ8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCF3Q9NUQ8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCF3Q9NUQ8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCF3Q9NUQ8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCF3Q9NUQ8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCF3Q9NUQ8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCF3Q9NUQ8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCF3Q9NUQ8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCF3Q9NUQ8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCF3Q9NUQ8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms