Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR61

DLL4, Delta-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL4Q9NR61 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DLL4Q9NR61 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DLL4Q9NR61 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DLL4Q9NR61 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DLL4Q9NR61 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DLL4Q9NR61 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DLL4Q9NR61 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DLL4Q9NR61 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DLL4Q9NR61 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DLL4Q9NR61 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DLL4Q9NR61 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DLL4Q9NR61 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DLL4Q9NR61 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DLL4Q9NR61 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DLL4Q9NR61 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DLL4Q9NR61 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DLL4Q9NR61 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DLL4Q9NR61 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DLL4Q9NR61 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DLL4Q9NR61 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DLL4Q9NR61 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DLL4Q9NR61 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DLL4Q9NR61 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DLL4Q9NR61 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DLL4Q9NR61 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DLL4Q9NR61 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DLL4Q9NR61 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DLL4Q9NR61 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DLL4Q9NR61 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DLL4Q9NR61 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DLL4Q9NR61 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DLL4Q9NR61 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DLL4Q9NR61 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DLL4Q9NR61 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DLL4Q9NR61 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DLL4Q9NR61 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DLL4Q9NR61 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DLL4Q9NR61 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DLL4Q9NR61 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DLL4Q9NR61 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DLL4Q9NR61 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DLL4Q9NR61 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DLL4Q9NR61 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DLL4Q9NR61 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DLL4Q9NR61 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DLL4Q9NR61 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DLL4Q9NR61 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DLL4Q9NR61 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DLL4Q9NR61 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DLL4Q9NR61 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DLL4Q9NR61 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DLL4Q9NR61 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DLL4Q9NR61 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DLL4Q9NR61 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DLL4Q9NR61 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DLL4Q9NR61 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DLL4Q9NR61 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DLL4Q9NR61 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DLL4Q9NR61 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DLL4Q9NR61 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DLL4Q9NR61 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DLL4Q9NR61 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DLL4Q9NR61 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DLL4Q9NR61 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DLL4Q9NR61 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DLL4Q9NR61 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DLL4Q9NR61 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DLL4Q9NR61 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DLL4Q9NR61 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DLL4Q9NR61 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DLL4Q9NR61 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DLL4Q9NR61 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DLL4Q9NR61 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DLL4Q9NR61 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DLL4Q9NR61 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DLL4Q9NR61 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DLL4Q9NR61 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DLL4Q9NR61 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DLL4Q9NR61 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DLL4Q9NR61 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DLL4Q9NR61 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DLL4Q9NR61 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DLL4Q9NR61 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DLL4Q9NR61 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DLL4Q9NR61 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DLL4Q9NR61 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DLL4Q9NR61 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DLL4Q9NR61 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DLL4Q9NR61 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DLL4Q9NR61 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DLL4Q9NR61 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DLL4Q9NR61 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DLL4Q9NR61 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DLL4Q9NR61 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DLL4Q9NR61 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DLL4Q9NR61 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DLL4Q9NR61 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DLL4Q9NR61 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DLL4Q9NR61 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DLL4Q9NR61 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms