Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CYLDQ9NQC7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CYLDQ9NQC7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CYLDQ9NQC7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CYLDQ9NQC7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CYLDQ9NQC7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CYLDQ9NQC7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CYLDQ9NQC7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CYLDQ9NQC7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CYLDQ9NQC7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CYLDQ9NQC7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CYLDQ9NQC7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CYLDQ9NQC7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CYLDQ9NQC7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CYLDQ9NQC7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CYLDQ9NQC7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CYLDQ9NQC7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CYLDQ9NQC7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CYLDQ9NQC7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CYLDQ9NQC7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CYLDQ9NQC7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CYLDQ9NQC7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CYLDQ9NQC7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CYLDQ9NQC7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CYLDQ9NQC7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CYLDQ9NQC7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CYLDQ9NQC7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CYLDQ9NQC7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CYLDQ9NQC7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CYLDQ9NQC7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CYLDQ9NQC7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CYLDQ9NQC7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CYLDQ9NQC7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CYLDQ9NQC7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CYLDQ9NQC7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CYLDQ9NQC7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CYLDQ9NQC7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CYLDQ9NQC7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CYLDQ9NQC7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CYLDQ9NQC7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CYLDQ9NQC7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CYLDQ9NQC7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CYLDQ9NQC7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CYLDQ9NQC7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CYLDQ9NQC7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CYLDQ9NQC7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CYLDQ9NQC7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CYLDQ9NQC7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CYLDQ9NQC7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CYLDQ9NQC7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CYLDQ9NQC7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CYLDQ9NQC7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CYLDQ9NQC7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CYLDQ9NQC7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CYLDQ9NQC7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CYLDQ9NQC7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CYLDQ9NQC7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CYLDQ9NQC7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CYLDQ9NQC7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CYLDQ9NQC7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CYLDQ9NQC7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CYLDQ9NQC7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CYLDQ9NQC7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CYLDQ9NQC7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CYLDQ9NQC7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CYLDQ9NQC7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CYLDQ9NQC7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CYLDQ9NQC7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CYLDQ9NQC7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CYLDQ9NQC7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CYLDQ9NQC7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CYLDQ9NQC7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CYLDQ9NQC7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CYLDQ9NQC7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CYLDQ9NQC7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CYLDQ9NQC7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CYLDQ9NQC7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CYLDQ9NQC7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CYLDQ9NQC7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CYLDQ9NQC7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CYLDQ9NQC7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CYLDQ9NQC7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CYLDQ9NQC7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CYLDQ9NQC7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CYLDQ9NQC7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CYLDQ9NQC7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CYLDQ9NQC7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CYLDQ9NQC7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CYLDQ9NQC7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CYLDQ9NQC7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CYLDQ9NQC7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CYLDQ9NQC7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CYLDQ9NQC7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CYLDQ9NQC7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CYLDQ9NQC7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CYLDQ9NQC7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CYLDQ9NQC7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CYLDQ9NQC7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CYLDQ9NQC7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CYLDQ9NQC7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
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