Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RTN4Q9NQC3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RTN4Q9NQC3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RTN4Q9NQC3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
RTN4Q9NQC3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RTN4Q9NQC3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RTN4Q9NQC3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RTN4Q9NQC3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RTN4Q9NQC3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RTN4Q9NQC3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RTN4Q9NQC3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RTN4Q9NQC3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RTN4Q9NQC3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RTN4Q9NQC3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RTN4Q9NQC3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RTN4Q9NQC3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RTN4Q9NQC3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RTN4Q9NQC3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RTN4Q9NQC3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RTN4Q9NQC3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RTN4Q9NQC3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RTN4Q9NQC3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RTN4Q9NQC3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RTN4Q9NQC3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RTN4Q9NQC3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RTN4Q9NQC3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
RTN4Q9NQC3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RTN4Q9NQC3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RTN4Q9NQC3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RTN4Q9NQC3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RTN4Q9NQC3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RTN4Q9NQC3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RTN4Q9NQC3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RTN4Q9NQC3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RTN4Q9NQC3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RTN4Q9NQC3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RTN4Q9NQC3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RTN4Q9NQC3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RTN4Q9NQC3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RTN4Q9NQC3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RTN4Q9NQC3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RTN4Q9NQC3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RTN4Q9NQC3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RTN4Q9NQC3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RTN4Q9NQC3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RTN4Q9NQC3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RTN4Q9NQC3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RTN4Q9NQC3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RTN4Q9NQC3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RTN4Q9NQC3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RTN4Q9NQC3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RTN4Q9NQC3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RTN4Q9NQC3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RTN4Q9NQC3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RTN4Q9NQC3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RTN4Q9NQC3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RTN4Q9NQC3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RTN4Q9NQC3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RTN4Q9NQC3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RTN4Q9NQC3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RTN4Q9NQC3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RTN4Q9NQC3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RTN4Q9NQC3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RTN4Q9NQC3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RTN4Q9NQC3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RTN4Q9NQC3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RTN4Q9NQC3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RTN4Q9NQC3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RTN4Q9NQC3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
RTN4Q9NQC3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RTN4Q9NQC3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
RTN4Q9NQC3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
RTN4Q9NQC3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RTN4Q9NQC3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RTN4Q9NQC3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RTN4Q9NQC3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RTN4Q9NQC3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RTN4Q9NQC3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RTN4Q9NQC3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RTN4Q9NQC3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RTN4Q9NQC3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RTN4Q9NQC3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RTN4Q9NQC3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RTN4Q9NQC3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RTN4Q9NQC3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RTN4Q9NQC3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RTN4Q9NQC3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RTN4Q9NQC3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RTN4Q9NQC3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RTN4Q9NQC3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RTN4Q9NQC3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RTN4Q9NQC3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RTN4Q9NQC3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RTN4Q9NQC3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
RTN4Q9NQC3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
RTN4Q9NQC3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
RTN4Q9NQC3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RTN4Q9NQC3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RTN4Q9NQC3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RTN4Q9NQC3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms