Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ89

C12orf4, Protein C12orf4, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf4Q9NQ89 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf4Q9NQ89 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf4Q9NQ89 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C12orf4Q9NQ89 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C12orf4Q9NQ89 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C12orf4Q9NQ89 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C12orf4Q9NQ89 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C12orf4Q9NQ89 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C12orf4Q9NQ89 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C12orf4Q9NQ89 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C12orf4Q9NQ89 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C12orf4Q9NQ89 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf4Q9NQ89 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C12orf4Q9NQ89 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf4Q9NQ89 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf4Q9NQ89 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C12orf4Q9NQ89 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C12orf4Q9NQ89 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf4Q9NQ89 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf4Q9NQ89 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf4Q9NQ89 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf4Q9NQ89 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C12orf4Q9NQ89 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C12orf4Q9NQ89 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf4Q9NQ89 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf4Q9NQ89 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf4Q9NQ89 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf4Q9NQ89 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf4Q9NQ89 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C12orf4Q9NQ89 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf4Q9NQ89 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf4Q9NQ89 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf4Q9NQ89 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf4Q9NQ89 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf4Q9NQ89 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C12orf4Q9NQ89 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C12orf4Q9NQ89 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C12orf4Q9NQ89 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf4Q9NQ89 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf4Q9NQ89 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf4Q9NQ89 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf4Q9NQ89 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C12orf4Q9NQ89 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf4Q9NQ89 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf4Q9NQ89 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf4Q9NQ89 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf4Q9NQ89 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C12orf4Q9NQ89 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C12orf4Q9NQ89 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C12orf4Q9NQ89 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C12orf4Q9NQ89 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C12orf4Q9NQ89 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C12orf4Q9NQ89 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf4Q9NQ89 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf4Q9NQ89 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf4Q9NQ89 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf4Q9NQ89 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf4Q9NQ89 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf4Q9NQ89 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf4Q9NQ89 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf4Q9NQ89 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf4Q9NQ89 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C12orf4Q9NQ89 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf4Q9NQ89 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf4Q9NQ89 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf4Q9NQ89 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf4Q9NQ89 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf4Q9NQ89 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C12orf4Q9NQ89 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C12orf4Q9NQ89 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C12orf4Q9NQ89 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C12orf4Q9NQ89 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C12orf4Q9NQ89 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C12orf4Q9NQ89 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C12orf4Q9NQ89 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C12orf4Q9NQ89 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C12orf4Q9NQ89 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C12orf4Q9NQ89 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C12orf4Q9NQ89 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C12orf4Q9NQ89 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C12orf4Q9NQ89 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C12orf4Q9NQ89 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C12orf4Q9NQ89 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C12orf4Q9NQ89 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf4Q9NQ89 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf4Q9NQ89 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf4Q9NQ89 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf4Q9NQ89 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf4Q9NQ89 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf4Q9NQ89 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf4Q9NQ89 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf4Q9NQ89 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C12orf4Q9NQ89 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C12orf4Q9NQ89 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C12orf4Q9NQ89 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C12orf4Q9NQ89 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C12orf4Q9NQ89 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C12orf4Q9NQ89 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C12orf4Q9NQ89 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C12orf4Q9NQ89 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms