Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ86

TRIM36, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM36, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM36Q9NQ86 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM36Q9NQ86 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM36Q9NQ86 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM36Q9NQ86 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM36Q9NQ86 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM36Q9NQ86 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM36Q9NQ86 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM36Q9NQ86 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM36Q9NQ86 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM36Q9NQ86 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM36Q9NQ86 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM36Q9NQ86 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM36Q9NQ86 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM36Q9NQ86 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM36Q9NQ86 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM36Q9NQ86 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM36Q9NQ86 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM36Q9NQ86 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM36Q9NQ86 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM36Q9NQ86 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM36Q9NQ86 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM36Q9NQ86 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM36Q9NQ86 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM36Q9NQ86 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM36Q9NQ86 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM36Q9NQ86 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM36Q9NQ86 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM36Q9NQ86 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM36Q9NQ86 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM36Q9NQ86 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM36Q9NQ86 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM36Q9NQ86 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM36Q9NQ86 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM36Q9NQ86 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM36Q9NQ86 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM36Q9NQ86 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM36Q9NQ86 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM36Q9NQ86 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM36Q9NQ86 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM36Q9NQ86 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM36Q9NQ86 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM36Q9NQ86 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM36Q9NQ86 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM36Q9NQ86 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM36Q9NQ86 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM36Q9NQ86 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM36Q9NQ86 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM36Q9NQ86 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM36Q9NQ86 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM36Q9NQ86 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM36Q9NQ86 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM36Q9NQ86 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM36Q9NQ86 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM36Q9NQ86 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM36Q9NQ86 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM36Q9NQ86 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM36Q9NQ86 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM36Q9NQ86 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM36Q9NQ86 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM36Q9NQ86 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM36Q9NQ86 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM36Q9NQ86 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM36Q9NQ86 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM36Q9NQ86 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM36Q9NQ86 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM36Q9NQ86 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM36Q9NQ86 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM36Q9NQ86 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM36Q9NQ86 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM36Q9NQ86 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM36Q9NQ86 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM36Q9NQ86 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM36Q9NQ86 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM36Q9NQ86 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM36Q9NQ86 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM36Q9NQ86 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM36Q9NQ86 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM36Q9NQ86 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM36Q9NQ86 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM36Q9NQ86 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM36Q9NQ86 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM36Q9NQ86 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM36Q9NQ86 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM36Q9NQ86 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM36Q9NQ86 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM36Q9NQ86 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM36Q9NQ86 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM36Q9NQ86 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM36Q9NQ86 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM36Q9NQ86 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM36Q9NQ86 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM36Q9NQ86 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM36Q9NQ86 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM36Q9NQ86 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM36Q9NQ86 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM36Q9NQ86 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM36Q9NQ86 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM36Q9NQ86 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM36Q9NQ86 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM36Q9NQ86 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms