Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MRPL40Q9NQ50 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MRPL40Q9NQ50 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MRPL40Q9NQ50 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MRPL40Q9NQ50 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MRPL40Q9NQ50 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MRPL40Q9NQ50 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MRPL40Q9NQ50 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MRPL40Q9NQ50 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MRPL40Q9NQ50 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MRPL40Q9NQ50 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MRPL40Q9NQ50 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MRPL40Q9NQ50 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MRPL40Q9NQ50 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MRPL40Q9NQ50 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MRPL40Q9NQ50 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MRPL40Q9NQ50 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MRPL40Q9NQ50 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MRPL40Q9NQ50 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MRPL40Q9NQ50 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MRPL40Q9NQ50 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MRPL40Q9NQ50 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MRPL40Q9NQ50 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MRPL40Q9NQ50 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MRPL40Q9NQ50 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MRPL40Q9NQ50 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MRPL40Q9NQ50 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MRPL40Q9NQ50 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MRPL40Q9NQ50 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
MRPL40Q9NQ50 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MRPL40Q9NQ50 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MRPL40Q9NQ50 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MRPL40Q9NQ50 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MRPL40Q9NQ50 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MRPL40Q9NQ50 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MRPL40Q9NQ50 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MRPL40Q9NQ50 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MRPL40Q9NQ50 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MRPL40Q9NQ50 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MRPL40Q9NQ50 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MRPL40Q9NQ50 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MRPL40Q9NQ50 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MRPL40Q9NQ50 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MRPL40Q9NQ50 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MRPL40Q9NQ50 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MRPL40Q9NQ50 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MRPL40Q9NQ50 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MRPL40Q9NQ50 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MRPL40Q9NQ50 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MRPL40Q9NQ50 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MRPL40Q9NQ50 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MRPL40Q9NQ50 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MRPL40Q9NQ50 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MRPL40Q9NQ50 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MRPL40Q9NQ50 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MRPL40Q9NQ50 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPL40Q9NQ50 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPL40Q9NQ50 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MRPL40Q9NQ50 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRPL40Q9NQ50 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRPL40Q9NQ50 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRPL40Q9NQ50 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRPL40Q9NQ50 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MRPL40Q9NQ50 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MRPL40Q9NQ50 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MRPL40Q9NQ50 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPL40Q9NQ50 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MRPL40Q9NQ50 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MRPL40Q9NQ50 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPL40Q9NQ50 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPL40Q9NQ50 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPL40Q9NQ50 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPL40Q9NQ50 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPL40Q9NQ50 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPL40Q9NQ50 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPL40Q9NQ50 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPL40Q9NQ50 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MRPL40Q9NQ50 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MRPL40Q9NQ50 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MRPL40Q9NQ50 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MRPL40Q9NQ50 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MRPL40Q9NQ50 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MRPL40Q9NQ50 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MRPL40Q9NQ50 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MRPL40Q9NQ50 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MRPL40Q9NQ50 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MRPL40Q9NQ50 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MRPL40Q9NQ50 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MRPL40Q9NQ50 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MRPL40Q9NQ50 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MRPL40Q9NQ50 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MRPL40Q9NQ50 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MRPL40Q9NQ50 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MRPL40Q9NQ50 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MRPL40Q9NQ50 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MRPL40Q9NQ50 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MRPL40Q9NQ50 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MRPL40Q9NQ50 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MRPL40Q9NQ50 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MRPL40Q9NQ50 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms