Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAP6

LIN7B, Protein lin-7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7BQ9HAP6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIN7BQ9HAP6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIN7BQ9HAP6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIN7BQ9HAP6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN7BQ9HAP6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIN7BQ9HAP6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIN7BQ9HAP6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIN7BQ9HAP6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIN7BQ9HAP6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIN7BQ9HAP6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN7BQ9HAP6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN7BQ9HAP6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIN7BQ9HAP6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIN7BQ9HAP6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIN7BQ9HAP6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIN7BQ9HAP6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIN7BQ9HAP6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIN7BQ9HAP6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LIN7BQ9HAP6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LIN7BQ9HAP6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIN7BQ9HAP6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN7BQ9HAP6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN7BQ9HAP6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIN7BQ9HAP6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIN7BQ9HAP6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIN7BQ9HAP6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIN7BQ9HAP6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIN7BQ9HAP6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIN7BQ9HAP6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIN7BQ9HAP6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIN7BQ9HAP6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIN7BQ9HAP6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIN7BQ9HAP6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIN7BQ9HAP6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIN7BQ9HAP6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIN7BQ9HAP6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN7BQ9HAP6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN7BQ9HAP6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIN7BQ9HAP6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIN7BQ9HAP6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIN7BQ9HAP6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIN7BQ9HAP6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIN7BQ9HAP6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIN7BQ9HAP6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIN7BQ9HAP6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIN7BQ9HAP6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIN7BQ9HAP6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIN7BQ9HAP6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIN7BQ9HAP6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LIN7BQ9HAP6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIN7BQ9HAP6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIN7BQ9HAP6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIN7BQ9HAP6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIN7BQ9HAP6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIN7BQ9HAP6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIN7BQ9HAP6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN7BQ9HAP6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN7BQ9HAP6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN7BQ9HAP6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIN7BQ9HAP6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIN7BQ9HAP6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN7BQ9HAP6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIN7BQ9HAP6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LIN7BQ9HAP6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIN7BQ9HAP6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIN7BQ9HAP6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIN7BQ9HAP6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIN7BQ9HAP6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIN7BQ9HAP6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIN7BQ9HAP6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN7BQ9HAP6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN7BQ9HAP6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN7BQ9HAP6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN7BQ9HAP6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN7BQ9HAP6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN7BQ9HAP6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN7BQ9HAP6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN7BQ9HAP6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN7BQ9HAP6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIN7BQ9HAP6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIN7BQ9HAP6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIN7BQ9HAP6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIN7BQ9HAP6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIN7BQ9HAP6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LIN7BQ9HAP6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN7BQ9HAP6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN7BQ9HAP6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LIN7BQ9HAP6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIN7BQ9HAP6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN7BQ9HAP6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN7BQ9HAP6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN7BQ9HAP6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN7BQ9HAP6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN7BQ9HAP6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN7BQ9HAP6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN7BQ9HAP6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN7BQ9HAP6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN7BQ9HAP6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN7BQ9HAP6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIN7BQ9HAP6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms