Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8P0

SRD5A3, Polyprenol reductase, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRD5A3Q9H8P0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRD5A3Q9H8P0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRD5A3Q9H8P0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRD5A3Q9H8P0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRD5A3Q9H8P0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRD5A3Q9H8P0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRD5A3Q9H8P0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRD5A3Q9H8P0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRD5A3Q9H8P0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRD5A3Q9H8P0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SRD5A3Q9H8P0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRD5A3Q9H8P0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRD5A3Q9H8P0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRD5A3Q9H8P0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRD5A3Q9H8P0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRD5A3Q9H8P0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRD5A3Q9H8P0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRD5A3Q9H8P0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRD5A3Q9H8P0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRD5A3Q9H8P0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRD5A3Q9H8P0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRD5A3Q9H8P0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRD5A3Q9H8P0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRD5A3Q9H8P0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRD5A3Q9H8P0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SRD5A3Q9H8P0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRD5A3Q9H8P0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRD5A3Q9H8P0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRD5A3Q9H8P0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRD5A3Q9H8P0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRD5A3Q9H8P0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRD5A3Q9H8P0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRD5A3Q9H8P0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SRD5A3Q9H8P0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRD5A3Q9H8P0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRD5A3Q9H8P0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRD5A3Q9H8P0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRD5A3Q9H8P0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRD5A3Q9H8P0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRD5A3Q9H8P0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRD5A3Q9H8P0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRD5A3Q9H8P0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRD5A3Q9H8P0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRD5A3Q9H8P0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRD5A3Q9H8P0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRD5A3Q9H8P0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRD5A3Q9H8P0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRD5A3Q9H8P0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRD5A3Q9H8P0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRD5A3Q9H8P0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRD5A3Q9H8P0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRD5A3Q9H8P0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRD5A3Q9H8P0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRD5A3Q9H8P0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRD5A3Q9H8P0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRD5A3Q9H8P0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRD5A3Q9H8P0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRD5A3Q9H8P0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRD5A3Q9H8P0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRD5A3Q9H8P0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRD5A3Q9H8P0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRD5A3Q9H8P0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRD5A3Q9H8P0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRD5A3Q9H8P0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRD5A3Q9H8P0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRD5A3Q9H8P0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRD5A3Q9H8P0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRD5A3Q9H8P0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRD5A3Q9H8P0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRD5A3Q9H8P0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRD5A3Q9H8P0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRD5A3Q9H8P0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRD5A3Q9H8P0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRD5A3Q9H8P0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRD5A3Q9H8P0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRD5A3Q9H8P0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRD5A3Q9H8P0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRD5A3Q9H8P0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRD5A3Q9H8P0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRD5A3Q9H8P0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRD5A3Q9H8P0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRD5A3Q9H8P0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRD5A3Q9H8P0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRD5A3Q9H8P0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRD5A3Q9H8P0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRD5A3Q9H8P0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SRD5A3Q9H8P0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRD5A3Q9H8P0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRD5A3Q9H8P0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRD5A3Q9H8P0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRD5A3Q9H8P0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRD5A3Q9H8P0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRD5A3Q9H8P0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRD5A3Q9H8P0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRD5A3Q9H8P0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRD5A3Q9H8P0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRD5A3Q9H8P0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRD5A3Q9H8P0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRD5A3Q9H8P0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRD5A3Q9H8P0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms