Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Z4

RANBP3, Ran-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP3Q9H6Z4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANBP3Q9H6Z4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANBP3Q9H6Z4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANBP3Q9H6Z4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANBP3Q9H6Z4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANBP3Q9H6Z4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANBP3Q9H6Z4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANBP3Q9H6Z4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANBP3Q9H6Z4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANBP3Q9H6Z4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANBP3Q9H6Z4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANBP3Q9H6Z4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANBP3Q9H6Z4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANBP3Q9H6Z4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANBP3Q9H6Z4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANBP3Q9H6Z4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANBP3Q9H6Z4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANBP3Q9H6Z4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANBP3Q9H6Z4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RANBP3Q9H6Z4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RANBP3Q9H6Z4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RANBP3Q9H6Z4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANBP3Q9H6Z4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANBP3Q9H6Z4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANBP3Q9H6Z4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANBP3Q9H6Z4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANBP3Q9H6Z4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANBP3Q9H6Z4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANBP3Q9H6Z4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANBP3Q9H6Z4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANBP3Q9H6Z4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANBP3Q9H6Z4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANBP3Q9H6Z4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANBP3Q9H6Z4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANBP3Q9H6Z4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANBP3Q9H6Z4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANBP3Q9H6Z4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANBP3Q9H6Z4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANBP3Q9H6Z4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANBP3Q9H6Z4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANBP3Q9H6Z4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANBP3Q9H6Z4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANBP3Q9H6Z4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANBP3Q9H6Z4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANBP3Q9H6Z4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANBP3Q9H6Z4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANBP3Q9H6Z4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANBP3Q9H6Z4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANBP3Q9H6Z4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANBP3Q9H6Z4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANBP3Q9H6Z4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANBP3Q9H6Z4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANBP3Q9H6Z4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANBP3Q9H6Z4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANBP3Q9H6Z4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RANBP3Q9H6Z4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RANBP3Q9H6Z4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANBP3Q9H6Z4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RANBP3Q9H6Z4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANBP3Q9H6Z4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANBP3Q9H6Z4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANBP3Q9H6Z4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANBP3Q9H6Z4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANBP3Q9H6Z4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RANBP3Q9H6Z4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANBP3Q9H6Z4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANBP3Q9H6Z4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANBP3Q9H6Z4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANBP3Q9H6Z4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANBP3Q9H6Z4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANBP3Q9H6Z4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANBP3Q9H6Z4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANBP3Q9H6Z4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANBP3Q9H6Z4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANBP3Q9H6Z4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RANBP3Q9H6Z4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RANBP3Q9H6Z4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RANBP3Q9H6Z4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RANBP3Q9H6Z4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RANBP3Q9H6Z4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RANBP3Q9H6Z4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RANBP3Q9H6Z4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RANBP3Q9H6Z4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RANBP3Q9H6Z4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RANBP3Q9H6Z4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RANBP3Q9H6Z4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RANBP3Q9H6Z4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANBP3Q9H6Z4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANBP3Q9H6Z4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANBP3Q9H6Z4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANBP3Q9H6Z4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANBP3Q9H6Z4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANBP3Q9H6Z4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RANBP3Q9H6Z4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANBP3Q9H6Z4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RANBP3Q9H6Z4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RANBP3Q9H6Z4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RANBP3Q9H6Z4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RANBP3Q9H6Z4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RANBP3Q9H6Z4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms