Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
SENP3Q9H4L4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
SENP3Q9H4L4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
SENP3Q9H4L4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
SENP3Q9H4L4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
SENP3Q9H4L4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC42.44■■■■■ 4.38
SENP3Q9H4L4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC42.44■■■■■ 4.38
SENP3Q9H4L4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
SENP3Q9H4L4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
SENP3Q9H4L4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
SENP3Q9H4L4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
SENP3Q9H4L4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
SENP3Q9H4L4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC42.39■■■■■ 4.38
SENP3Q9H4L4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.38
SENP3Q9H4L4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
SENP3Q9H4L4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
SENP3Q9H4L4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
SENP3Q9H4L4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
SENP3Q9H4L4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC42.22■■■■■ 4.35
SENP3Q9H4L4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
SENP3Q9H4L4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
SENP3Q9H4L4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
SENP3Q9H4L4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC42.17■■■■■ 4.34
SENP3Q9H4L4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
SENP3Q9H4L4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
SENP3Q9H4L4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
SENP3Q9H4L4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
SENP3Q9H4L4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
SENP3Q9H4L4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
SENP3Q9H4L4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
SENP3Q9H4L4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
SENP3Q9H4L4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
SENP3Q9H4L4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
SENP3Q9H4L4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
SENP3Q9H4L4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
SENP3Q9H4L4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
SENP3Q9H4L4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC41.73■■■■■ 4.27
SENP3Q9H4L4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
SENP3Q9H4L4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
SENP3Q9H4L4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
SENP3Q9H4L4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
SENP3Q9H4L4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
SENP3Q9H4L4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
SENP3Q9H4L4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
SENP3Q9H4L4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
SENP3Q9H4L4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
SENP3Q9H4L4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
SENP3Q9H4L4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
SENP3Q9H4L4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
SENP3Q9H4L4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
SENP3Q9H4L4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
SENP3Q9H4L4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
SENP3Q9H4L4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
SENP3Q9H4L4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
SENP3Q9H4L4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
SENP3Q9H4L4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
SENP3Q9H4L4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
SENP3Q9H4L4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
SENP3Q9H4L4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
SENP3Q9H4L4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
SENP3Q9H4L4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
SENP3Q9H4L4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
SENP3Q9H4L4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
SENP3Q9H4L4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
SENP3Q9H4L4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
SENP3Q9H4L4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
SENP3Q9H4L4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
SENP3Q9H4L4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC41.18■■■■■ 4.18
SENP3Q9H4L4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
SENP3Q9H4L4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
SENP3Q9H4L4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
SENP3Q9H4L4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
SENP3Q9H4L4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
SENP3Q9H4L4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
SENP3Q9H4L4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC41.07■■■■■ 4.17
SENP3Q9H4L4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
SENP3Q9H4L4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
SENP3Q9H4L4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
SENP3Q9H4L4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SENP3Q9H4L4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SENP3Q9H4L4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
SENP3Q9H4L4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
SENP3Q9H4L4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
SENP3Q9H4L4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
SENP3Q9H4L4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
SENP3Q9H4L4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
SENP3Q9H4L4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
SENP3Q9H4L4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
SENP3Q9H4L4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
SENP3Q9H4L4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
SENP3Q9H4L4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SENP3Q9H4L4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
SENP3Q9H4L4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
SENP3Q9H4L4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
SENP3Q9H4L4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
SENP3Q9H4L4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
SENP3Q9H4L4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
SENP3Q9H4L4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
SENP3Q9H4L4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
SENP3Q9H4L4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms