Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3R2

MUC13, Mucin-13, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC13Q9H3R2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MUC13Q9H3R2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MUC13Q9H3R2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MUC13Q9H3R2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MUC13Q9H3R2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MUC13Q9H3R2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MUC13Q9H3R2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MUC13Q9H3R2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MUC13Q9H3R2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MUC13Q9H3R2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MUC13Q9H3R2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MUC13Q9H3R2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MUC13Q9H3R2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MUC13Q9H3R2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MUC13Q9H3R2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MUC13Q9H3R2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MUC13Q9H3R2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MUC13Q9H3R2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MUC13Q9H3R2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MUC13Q9H3R2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MUC13Q9H3R2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MUC13Q9H3R2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MUC13Q9H3R2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MUC13Q9H3R2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MUC13Q9H3R2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MUC13Q9H3R2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MUC13Q9H3R2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MUC13Q9H3R2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MUC13Q9H3R2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MUC13Q9H3R2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MUC13Q9H3R2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MUC13Q9H3R2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MUC13Q9H3R2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MUC13Q9H3R2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MUC13Q9H3R2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MUC13Q9H3R2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MUC13Q9H3R2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MUC13Q9H3R2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MUC13Q9H3R2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MUC13Q9H3R2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MUC13Q9H3R2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MUC13Q9H3R2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MUC13Q9H3R2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MUC13Q9H3R2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MUC13Q9H3R2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MUC13Q9H3R2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MUC13Q9H3R2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MUC13Q9H3R2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MUC13Q9H3R2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MUC13Q9H3R2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MUC13Q9H3R2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MUC13Q9H3R2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MUC13Q9H3R2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MUC13Q9H3R2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MUC13Q9H3R2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MUC13Q9H3R2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MUC13Q9H3R2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MUC13Q9H3R2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MUC13Q9H3R2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MUC13Q9H3R2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MUC13Q9H3R2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MUC13Q9H3R2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MUC13Q9H3R2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MUC13Q9H3R2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MUC13Q9H3R2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MUC13Q9H3R2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MUC13Q9H3R2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MUC13Q9H3R2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MUC13Q9H3R2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MUC13Q9H3R2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MUC13Q9H3R2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MUC13Q9H3R2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MUC13Q9H3R2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MUC13Q9H3R2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MUC13Q9H3R2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MUC13Q9H3R2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MUC13Q9H3R2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MUC13Q9H3R2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MUC13Q9H3R2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MUC13Q9H3R2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MUC13Q9H3R2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MUC13Q9H3R2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MUC13Q9H3R2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MUC13Q9H3R2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MUC13Q9H3R2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MUC13Q9H3R2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MUC13Q9H3R2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MUC13Q9H3R2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MUC13Q9H3R2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MUC13Q9H3R2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MUC13Q9H3R2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MUC13Q9H3R2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MUC13Q9H3R2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MUC13Q9H3R2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MUC13Q9H3R2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MUC13Q9H3R2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MUC13Q9H3R2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MUC13Q9H3R2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MUC13Q9H3R2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MUC13Q9H3R2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms