Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZW8

MS4A7, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A7Q9GZW8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A7Q9GZW8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A7Q9GZW8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A7Q9GZW8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A7Q9GZW8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A7Q9GZW8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A7Q9GZW8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A7Q9GZW8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MS4A7Q9GZW8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A7Q9GZW8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A7Q9GZW8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A7Q9GZW8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A7Q9GZW8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A7Q9GZW8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A7Q9GZW8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A7Q9GZW8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A7Q9GZW8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A7Q9GZW8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A7Q9GZW8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A7Q9GZW8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A7Q9GZW8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A7Q9GZW8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A7Q9GZW8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A7Q9GZW8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A7Q9GZW8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A7Q9GZW8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A7Q9GZW8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A7Q9GZW8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A7Q9GZW8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A7Q9GZW8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A7Q9GZW8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A7Q9GZW8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A7Q9GZW8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A7Q9GZW8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A7Q9GZW8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A7Q9GZW8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A7Q9GZW8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A7Q9GZW8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A7Q9GZW8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A7Q9GZW8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A7Q9GZW8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A7Q9GZW8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A7Q9GZW8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A7Q9GZW8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MS4A7Q9GZW8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A7Q9GZW8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A7Q9GZW8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A7Q9GZW8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A7Q9GZW8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A7Q9GZW8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A7Q9GZW8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A7Q9GZW8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A7Q9GZW8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A7Q9GZW8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A7Q9GZW8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A7Q9GZW8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A7Q9GZW8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A7Q9GZW8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A7Q9GZW8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A7Q9GZW8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A7Q9GZW8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A7Q9GZW8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A7Q9GZW8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A7Q9GZW8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A7Q9GZW8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A7Q9GZW8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A7Q9GZW8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A7Q9GZW8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A7Q9GZW8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A7Q9GZW8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A7Q9GZW8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A7Q9GZW8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A7Q9GZW8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A7Q9GZW8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A7Q9GZW8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A7Q9GZW8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A7Q9GZW8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A7Q9GZW8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A7Q9GZW8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A7Q9GZW8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A7Q9GZW8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MS4A7Q9GZW8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A7Q9GZW8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A7Q9GZW8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MS4A7Q9GZW8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MS4A7Q9GZW8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A7Q9GZW8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A7Q9GZW8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A7Q9GZW8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A7Q9GZW8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A7Q9GZW8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A7Q9GZW8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A7Q9GZW8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A7Q9GZW8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A7Q9GZW8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A7Q9GZW8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A7Q9GZW8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A7Q9GZW8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A7Q9GZW8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A7Q9GZW8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms