Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
MCOLN1Q9GZU1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
MCOLN1Q9GZU1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
MCOLN1Q9GZU1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
MCOLN1Q9GZU1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
MCOLN1Q9GZU1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
MCOLN1Q9GZU1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
MCOLN1Q9GZU1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
MCOLN1Q9GZU1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MCOLN1Q9GZU1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
MCOLN1Q9GZU1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MCOLN1Q9GZU1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
MCOLN1Q9GZU1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
MCOLN1Q9GZU1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
MCOLN1Q9GZU1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
MCOLN1Q9GZU1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
MCOLN1Q9GZU1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
MCOLN1Q9GZU1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MCOLN1Q9GZU1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
MCOLN1Q9GZU1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
MCOLN1Q9GZU1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
MCOLN1Q9GZU1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MCOLN1Q9GZU1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MCOLN1Q9GZU1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
MCOLN1Q9GZU1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
MCOLN1Q9GZU1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
MCOLN1Q9GZU1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
MCOLN1Q9GZU1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
MCOLN1Q9GZU1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
MCOLN1Q9GZU1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MCOLN1Q9GZU1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MCOLN1Q9GZU1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
MCOLN1Q9GZU1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
MCOLN1Q9GZU1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MCOLN1Q9GZU1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
MCOLN1Q9GZU1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
MCOLN1Q9GZU1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
MCOLN1Q9GZU1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MCOLN1Q9GZU1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
MCOLN1Q9GZU1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
MCOLN1Q9GZU1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
MCOLN1Q9GZU1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
MCOLN1Q9GZU1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
MCOLN1Q9GZU1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
MCOLN1Q9GZU1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
MCOLN1Q9GZU1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
MCOLN1Q9GZU1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
MCOLN1Q9GZU1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
MCOLN1Q9GZU1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
MCOLN1Q9GZU1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
MCOLN1Q9GZU1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
MCOLN1Q9GZU1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
MCOLN1Q9GZU1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
MCOLN1Q9GZU1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
MCOLN1Q9GZU1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
MCOLN1Q9GZU1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
MCOLN1Q9GZU1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
MCOLN1Q9GZU1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
MCOLN1Q9GZU1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MCOLN1Q9GZU1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
MCOLN1Q9GZU1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
MCOLN1Q9GZU1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
MCOLN1Q9GZU1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
MCOLN1Q9GZU1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
MCOLN1Q9GZU1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
MCOLN1Q9GZU1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
MCOLN1Q9GZU1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
MCOLN1Q9GZU1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
MCOLN1Q9GZU1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
MCOLN1Q9GZU1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
MCOLN1Q9GZU1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MCOLN1Q9GZU1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MCOLN1Q9GZU1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MCOLN1Q9GZU1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
MCOLN1Q9GZU1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
MCOLN1Q9GZU1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
MCOLN1Q9GZU1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MCOLN1Q9GZU1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
MCOLN1Q9GZU1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
MCOLN1Q9GZU1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
MCOLN1Q9GZU1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
MCOLN1Q9GZU1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MCOLN1Q9GZU1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
MCOLN1Q9GZU1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
MCOLN1Q9GZU1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
MCOLN1Q9GZU1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
MCOLN1Q9GZU1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MCOLN1Q9GZU1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MCOLN1Q9GZU1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MCOLN1Q9GZU1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MCOLN1Q9GZU1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MCOLN1Q9GZU1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
MCOLN1Q9GZU1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MCOLN1Q9GZU1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MCOLN1Q9GZU1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MCOLN1Q9GZU1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
MCOLN1Q9GZU1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MCOLN1Q9GZU1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MCOLN1Q9GZU1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MCOLN1Q9GZU1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms