Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC94Q9BW85 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC94Q9BW85 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC94Q9BW85 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC94Q9BW85 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC94Q9BW85 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC94Q9BW85 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC94Q9BW85 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC94Q9BW85 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CCDC94Q9BW85 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC94Q9BW85 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC94Q9BW85 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC94Q9BW85 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC94Q9BW85 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC94Q9BW85 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC94Q9BW85 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CCDC94Q9BW85 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC94Q9BW85 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC94Q9BW85 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC94Q9BW85 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC94Q9BW85 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC94Q9BW85 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC94Q9BW85 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC94Q9BW85 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC94Q9BW85 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC94Q9BW85 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC94Q9BW85 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
CCDC94Q9BW85 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC94Q9BW85 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC94Q9BW85 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC94Q9BW85 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC94Q9BW85 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC94Q9BW85 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC94Q9BW85 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CCDC94Q9BW85 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC94Q9BW85 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC94Q9BW85 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC94Q9BW85 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC94Q9BW85 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC94Q9BW85 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC94Q9BW85 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC94Q9BW85 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC94Q9BW85 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC94Q9BW85 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC94Q9BW85 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC94Q9BW85 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC94Q9BW85 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC94Q9BW85 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC94Q9BW85 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC94Q9BW85 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC94Q9BW85 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC94Q9BW85 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC94Q9BW85 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC94Q9BW85 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC94Q9BW85 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC94Q9BW85 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC94Q9BW85 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC94Q9BW85 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC94Q9BW85 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC94Q9BW85 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC94Q9BW85 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC94Q9BW85 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC94Q9BW85 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC94Q9BW85 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC94Q9BW85 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC94Q9BW85 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC94Q9BW85 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC94Q9BW85 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC94Q9BW85 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC94Q9BW85 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC94Q9BW85 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC94Q9BW85 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC94Q9BW85 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC94Q9BW85 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC94Q9BW85 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC94Q9BW85 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC94Q9BW85 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC94Q9BW85 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC94Q9BW85 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC94Q9BW85 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC94Q9BW85 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC94Q9BW85 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC94Q9BW85 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC94Q9BW85 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC94Q9BW85 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC94Q9BW85 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC94Q9BW85 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC94Q9BW85 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC94Q9BW85 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC94Q9BW85 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC94Q9BW85 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC94Q9BW85 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC94Q9BW85 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC94Q9BW85 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC94Q9BW85 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC94Q9BW85 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC94Q9BW85 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC94Q9BW85 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC94Q9BW85 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC94Q9BW85 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms