Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PBDC1Q9BVG4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PBDC1Q9BVG4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PBDC1Q9BVG4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PBDC1Q9BVG4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PBDC1Q9BVG4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBDC1Q9BVG4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBDC1Q9BVG4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBDC1Q9BVG4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PBDC1Q9BVG4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PBDC1Q9BVG4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PBDC1Q9BVG4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PBDC1Q9BVG4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBDC1Q9BVG4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBDC1Q9BVG4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBDC1Q9BVG4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBDC1Q9BVG4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBDC1Q9BVG4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBDC1Q9BVG4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBDC1Q9BVG4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBDC1Q9BVG4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBDC1Q9BVG4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PBDC1Q9BVG4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PBDC1Q9BVG4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBDC1Q9BVG4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBDC1Q9BVG4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBDC1Q9BVG4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBDC1Q9BVG4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBDC1Q9BVG4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBDC1Q9BVG4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBDC1Q9BVG4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBDC1Q9BVG4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBDC1Q9BVG4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBDC1Q9BVG4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBDC1Q9BVG4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBDC1Q9BVG4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBDC1Q9BVG4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBDC1Q9BVG4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBDC1Q9BVG4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBDC1Q9BVG4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PBDC1Q9BVG4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PBDC1Q9BVG4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBDC1Q9BVG4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBDC1Q9BVG4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBDC1Q9BVG4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBDC1Q9BVG4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBDC1Q9BVG4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBDC1Q9BVG4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBDC1Q9BVG4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBDC1Q9BVG4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBDC1Q9BVG4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBDC1Q9BVG4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PBDC1Q9BVG4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PBDC1Q9BVG4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBDC1Q9BVG4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBDC1Q9BVG4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBDC1Q9BVG4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBDC1Q9BVG4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBDC1Q9BVG4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBDC1Q9BVG4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBDC1Q9BVG4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBDC1Q9BVG4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBDC1Q9BVG4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBDC1Q9BVG4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBDC1Q9BVG4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBDC1Q9BVG4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBDC1Q9BVG4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBDC1Q9BVG4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBDC1Q9BVG4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBDC1Q9BVG4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBDC1Q9BVG4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBDC1Q9BVG4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBDC1Q9BVG4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PBDC1Q9BVG4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBDC1Q9BVG4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBDC1Q9BVG4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBDC1Q9BVG4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBDC1Q9BVG4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBDC1Q9BVG4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBDC1Q9BVG4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBDC1Q9BVG4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBDC1Q9BVG4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBDC1Q9BVG4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBDC1Q9BVG4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBDC1Q9BVG4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBDC1Q9BVG4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBDC1Q9BVG4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBDC1Q9BVG4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBDC1Q9BVG4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBDC1Q9BVG4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBDC1Q9BVG4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PBDC1Q9BVG4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PBDC1Q9BVG4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBDC1Q9BVG4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBDC1Q9BVG4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBDC1Q9BVG4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBDC1Q9BVG4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PBDC1Q9BVG4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PBDC1Q9BVG4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PBDC1Q9BVG4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms