Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TUBB2BQ9BVA1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TUBB2BQ9BVA1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TUBB2BQ9BVA1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TUBB2BQ9BVA1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TUBB2BQ9BVA1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TUBB2BQ9BVA1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
TUBB2BQ9BVA1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TUBB2BQ9BVA1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TUBB2BQ9BVA1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TUBB2BQ9BVA1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
TUBB2BQ9BVA1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TUBB2BQ9BVA1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TUBB2BQ9BVA1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TUBB2BQ9BVA1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TUBB2BQ9BVA1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
TUBB2BQ9BVA1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TUBB2BQ9BVA1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TUBB2BQ9BVA1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TUBB2BQ9BVA1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TUBB2BQ9BVA1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TUBB2BQ9BVA1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TUBB2BQ9BVA1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TUBB2BQ9BVA1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TUBB2BQ9BVA1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TUBB2BQ9BVA1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TUBB2BQ9BVA1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TUBB2BQ9BVA1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TUBB2BQ9BVA1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TUBB2BQ9BVA1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TUBB2BQ9BVA1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TUBB2BQ9BVA1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TUBB2BQ9BVA1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TUBB2BQ9BVA1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TUBB2BQ9BVA1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TUBB2BQ9BVA1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TUBB2BQ9BVA1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TUBB2BQ9BVA1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TUBB2BQ9BVA1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TUBB2BQ9BVA1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TUBB2BQ9BVA1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TUBB2BQ9BVA1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TUBB2BQ9BVA1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TUBB2BQ9BVA1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TUBB2BQ9BVA1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TUBB2BQ9BVA1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TUBB2BQ9BVA1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TUBB2BQ9BVA1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TUBB2BQ9BVA1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TUBB2BQ9BVA1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TUBB2BQ9BVA1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TUBB2BQ9BVA1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TUBB2BQ9BVA1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TUBB2BQ9BVA1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TUBB2BQ9BVA1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TUBB2BQ9BVA1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TUBB2BQ9BVA1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TUBB2BQ9BVA1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TUBB2BQ9BVA1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TUBB2BQ9BVA1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TUBB2BQ9BVA1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TUBB2BQ9BVA1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TUBB2BQ9BVA1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TUBB2BQ9BVA1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TUBB2BQ9BVA1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TUBB2BQ9BVA1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TUBB2BQ9BVA1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TUBB2BQ9BVA1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TUBB2BQ9BVA1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TUBB2BQ9BVA1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TUBB2BQ9BVA1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TUBB2BQ9BVA1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TUBB2BQ9BVA1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TUBB2BQ9BVA1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TUBB2BQ9BVA1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TUBB2BQ9BVA1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TUBB2BQ9BVA1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TUBB2BQ9BVA1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TUBB2BQ9BVA1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TUBB2BQ9BVA1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TUBB2BQ9BVA1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TUBB2BQ9BVA1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TUBB2BQ9BVA1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TUBB2BQ9BVA1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TUBB2BQ9BVA1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TUBB2BQ9BVA1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TUBB2BQ9BVA1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TUBB2BQ9BVA1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TUBB2BQ9BVA1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TUBB2BQ9BVA1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TUBB2BQ9BVA1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TUBB2BQ9BVA1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TUBB2BQ9BVA1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TUBB2BQ9BVA1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TUBB2BQ9BVA1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TUBB2BQ9BVA1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TUBB2BQ9BVA1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TUBB2BQ9BVA1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TUBB2BQ9BVA1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms