Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV35

SLC25A23, Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-3, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A23Q9BV35 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC25A23Q9BV35 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC25A23Q9BV35 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC25A23Q9BV35 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC25A23Q9BV35 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC25A23Q9BV35 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC25A23Q9BV35 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC25A23Q9BV35 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC25A23Q9BV35 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC25A23Q9BV35 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC25A23Q9BV35 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC25A23Q9BV35 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC25A23Q9BV35 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC25A23Q9BV35 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC25A23Q9BV35 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC25A23Q9BV35 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC25A23Q9BV35 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC25A23Q9BV35 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC25A23Q9BV35 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC25A23Q9BV35 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC25A23Q9BV35 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC25A23Q9BV35 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC25A23Q9BV35 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC25A23Q9BV35 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC25A23Q9BV35 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC25A23Q9BV35 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC25A23Q9BV35 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC25A23Q9BV35 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC25A23Q9BV35 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC25A23Q9BV35 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC25A23Q9BV35 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC25A23Q9BV35 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC25A23Q9BV35 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC25A23Q9BV35 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC25A23Q9BV35 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC25A23Q9BV35 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC25A23Q9BV35 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC25A23Q9BV35 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC25A23Q9BV35 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC25A23Q9BV35 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC25A23Q9BV35 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC25A23Q9BV35 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC25A23Q9BV35 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC25A23Q9BV35 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC25A23Q9BV35 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC25A23Q9BV35 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC25A23Q9BV35 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC25A23Q9BV35 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC25A23Q9BV35 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC25A23Q9BV35 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC25A23Q9BV35 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC25A23Q9BV35 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC25A23Q9BV35 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC25A23Q9BV35 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC25A23Q9BV35 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC25A23Q9BV35 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC25A23Q9BV35 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC25A23Q9BV35 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC25A23Q9BV35 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC25A23Q9BV35 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC25A23Q9BV35 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC25A23Q9BV35 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC25A23Q9BV35 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC25A23Q9BV35 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC25A23Q9BV35 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC25A23Q9BV35 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC25A23Q9BV35 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC25A23Q9BV35 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC25A23Q9BV35 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC25A23Q9BV35 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC25A23Q9BV35 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC25A23Q9BV35 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC25A23Q9BV35 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC25A23Q9BV35 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC25A23Q9BV35 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC25A23Q9BV35 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC25A23Q9BV35 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC25A23Q9BV35 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC25A23Q9BV35 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC25A23Q9BV35 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC25A23Q9BV35 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC25A23Q9BV35 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC25A23Q9BV35 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC25A23Q9BV35 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC25A23Q9BV35 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC25A23Q9BV35 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC25A23Q9BV35 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC25A23Q9BV35 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC25A23Q9BV35 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC25A23Q9BV35 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC25A23Q9BV35 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC25A23Q9BV35 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC25A23Q9BV35 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC25A23Q9BV35 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC25A23Q9BV35 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC25A23Q9BV35 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC25A23Q9BV35 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC25A23Q9BV35 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC25A23Q9BV35 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC25A23Q9BV35 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms