Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUN5

CCDC28B, Coiled-coil domain-containing protein 28B, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC28BQ9BUN5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC28BQ9BUN5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC28BQ9BUN5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC28BQ9BUN5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC28BQ9BUN5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC28BQ9BUN5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC28BQ9BUN5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC28BQ9BUN5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC28BQ9BUN5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC28BQ9BUN5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC28BQ9BUN5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC28BQ9BUN5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC28BQ9BUN5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC28BQ9BUN5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC28BQ9BUN5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC28BQ9BUN5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC28BQ9BUN5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC28BQ9BUN5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC28BQ9BUN5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC28BQ9BUN5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC28BQ9BUN5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC28BQ9BUN5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC28BQ9BUN5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC28BQ9BUN5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC28BQ9BUN5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC28BQ9BUN5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC28BQ9BUN5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC28BQ9BUN5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC28BQ9BUN5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC28BQ9BUN5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC28BQ9BUN5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC28BQ9BUN5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC28BQ9BUN5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC28BQ9BUN5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC28BQ9BUN5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC28BQ9BUN5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC28BQ9BUN5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC28BQ9BUN5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC28BQ9BUN5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC28BQ9BUN5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC28BQ9BUN5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC28BQ9BUN5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC28BQ9BUN5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC28BQ9BUN5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC28BQ9BUN5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC28BQ9BUN5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC28BQ9BUN5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC28BQ9BUN5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC28BQ9BUN5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC28BQ9BUN5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC28BQ9BUN5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC28BQ9BUN5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC28BQ9BUN5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC28BQ9BUN5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC28BQ9BUN5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC28BQ9BUN5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC28BQ9BUN5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC28BQ9BUN5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC28BQ9BUN5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC28BQ9BUN5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC28BQ9BUN5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC28BQ9BUN5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC28BQ9BUN5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC28BQ9BUN5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC28BQ9BUN5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC28BQ9BUN5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC28BQ9BUN5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC28BQ9BUN5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC28BQ9BUN5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC28BQ9BUN5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC28BQ9BUN5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC28BQ9BUN5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC28BQ9BUN5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC28BQ9BUN5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC28BQ9BUN5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC28BQ9BUN5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC28BQ9BUN5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC28BQ9BUN5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC28BQ9BUN5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC28BQ9BUN5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC28BQ9BUN5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC28BQ9BUN5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC28BQ9BUN5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC28BQ9BUN5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC28BQ9BUN5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC28BQ9BUN5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC28BQ9BUN5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC28BQ9BUN5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC28BQ9BUN5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC28BQ9BUN5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC28BQ9BUN5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC28BQ9BUN5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC28BQ9BUN5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC28BQ9BUN5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC28BQ9BUN5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC28BQ9BUN5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC28BQ9BUN5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC28BQ9BUN5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC28BQ9BUN5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC28BQ9BUN5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms