Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TXNDC17Q9BRA2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNDC17Q9BRA2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNDC17Q9BRA2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNDC17Q9BRA2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNDC17Q9BRA2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNDC17Q9BRA2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TXNDC17Q9BRA2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TXNDC17Q9BRA2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TXNDC17Q9BRA2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNDC17Q9BRA2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNDC17Q9BRA2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNDC17Q9BRA2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNDC17Q9BRA2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNDC17Q9BRA2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TXNDC17Q9BRA2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNDC17Q9BRA2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNDC17Q9BRA2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNDC17Q9BRA2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNDC17Q9BRA2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC17Q9BRA2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNDC17Q9BRA2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNDC17Q9BRA2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNDC17Q9BRA2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNDC17Q9BRA2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNDC17Q9BRA2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNDC17Q9BRA2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNDC17Q9BRA2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNDC17Q9BRA2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNDC17Q9BRA2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNDC17Q9BRA2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNDC17Q9BRA2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNDC17Q9BRA2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNDC17Q9BRA2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC17Q9BRA2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC17Q9BRA2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC17Q9BRA2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC17Q9BRA2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC17Q9BRA2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC17Q9BRA2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TXNDC17Q9BRA2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNDC17Q9BRA2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNDC17Q9BRA2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TXNDC17Q9BRA2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TXNDC17Q9BRA2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TXNDC17Q9BRA2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TXNDC17Q9BRA2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TXNDC17Q9BRA2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TXNDC17Q9BRA2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNDC17Q9BRA2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNDC17Q9BRA2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC17Q9BRA2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC17Q9BRA2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TXNDC17Q9BRA2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TXNDC17Q9BRA2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TXNDC17Q9BRA2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TXNDC17Q9BRA2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TXNDC17Q9BRA2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TXNDC17Q9BRA2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TXNDC17Q9BRA2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNDC17Q9BRA2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNDC17Q9BRA2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNDC17Q9BRA2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNDC17Q9BRA2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNDC17Q9BRA2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TXNDC17Q9BRA2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC17Q9BRA2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC17Q9BRA2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TXNDC17Q9BRA2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TXNDC17Q9BRA2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TXNDC17Q9BRA2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TXNDC17Q9BRA2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TXNDC17Q9BRA2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TXNDC17Q9BRA2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TXNDC17Q9BRA2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TXNDC17Q9BRA2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TXNDC17Q9BRA2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TXNDC17Q9BRA2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TXNDC17Q9BRA2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TXNDC17Q9BRA2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TXNDC17Q9BRA2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TXNDC17Q9BRA2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TXNDC17Q9BRA2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNDC17Q9BRA2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNDC17Q9BRA2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNDC17Q9BRA2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNDC17Q9BRA2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNDC17Q9BRA2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TXNDC17Q9BRA2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TXNDC17Q9BRA2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TXNDC17Q9BRA2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TXNDC17Q9BRA2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNDC17Q9BRA2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNDC17Q9BRA2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNDC17Q9BRA2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TXNDC17Q9BRA2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TXNDC17Q9BRA2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TXNDC17Q9BRA2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TXNDC17Q9BRA2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TXNDC17Q9BRA2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms