Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT3Q9BQG1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT3Q9BQG1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT3Q9BQG1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT3Q9BQG1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT3Q9BQG1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT3Q9BQG1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT3Q9BQG1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT3Q9BQG1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT3Q9BQG1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT3Q9BQG1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT3Q9BQG1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT3Q9BQG1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT3Q9BQG1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT3Q9BQG1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT3Q9BQG1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT3Q9BQG1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT3Q9BQG1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT3Q9BQG1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT3Q9BQG1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT3Q9BQG1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT3Q9BQG1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT3Q9BQG1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT3Q9BQG1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT3Q9BQG1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT3Q9BQG1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT3Q9BQG1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT3Q9BQG1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT3Q9BQG1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT3Q9BQG1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT3Q9BQG1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYT3Q9BQG1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT3Q9BQG1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT3Q9BQG1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT3Q9BQG1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT3Q9BQG1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT3Q9BQG1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT3Q9BQG1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT3Q9BQG1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT3Q9BQG1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT3Q9BQG1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT3Q9BQG1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT3Q9BQG1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT3Q9BQG1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT3Q9BQG1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT3Q9BQG1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT3Q9BQG1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT3Q9BQG1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT3Q9BQG1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT3Q9BQG1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT3Q9BQG1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT3Q9BQG1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT3Q9BQG1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT3Q9BQG1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT3Q9BQG1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT3Q9BQG1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT3Q9BQG1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT3Q9BQG1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT3Q9BQG1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT3Q9BQG1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT3Q9BQG1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT3Q9BQG1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT3Q9BQG1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT3Q9BQG1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT3Q9BQG1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT3Q9BQG1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT3Q9BQG1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT3Q9BQG1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT3Q9BQG1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT3Q9BQG1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT3Q9BQG1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT3Q9BQG1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT3Q9BQG1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT3Q9BQG1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT3Q9BQG1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT3Q9BQG1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT3Q9BQG1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT3Q9BQG1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT3Q9BQG1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT3Q9BQG1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT3Q9BQG1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT3Q9BQG1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYT3Q9BQG1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT3Q9BQG1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT3Q9BQG1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT3Q9BQG1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT3Q9BQG1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT3Q9BQG1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT3Q9BQG1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT3Q9BQG1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT3Q9BQG1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT3Q9BQG1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT3Q9BQG1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT3Q9BQG1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYT3Q9BQG1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT3Q9BQG1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT3Q9BQG1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT3Q9BQG1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT3Q9BQG1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT3Q9BQG1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms