Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
RGPD5Q99666 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
RGPD5Q99666 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
RGPD5Q99666 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
RGPD5Q99666 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
RGPD5Q99666 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.91
RGPD5Q99666 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
RGPD5Q99666 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
RGPD5Q99666 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
RGPD5Q99666 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
RGPD5Q99666 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
RGPD5Q99666 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
RGPD5Q99666 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
RGPD5Q99666 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
RGPD5Q99666 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
RGPD5Q99666 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
RGPD5Q99666 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
RGPD5Q99666 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
RGPD5Q99666 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
RGPD5Q99666 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
RGPD5Q99666 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
RGPD5Q99666 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
RGPD5Q99666 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
RGPD5Q99666 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
RGPD5Q99666 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
RGPD5Q99666 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
RGPD5Q99666 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
RGPD5Q99666 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
RGPD5Q99666 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
RGPD5Q99666 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
RGPD5Q99666 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
RGPD5Q99666 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
RGPD5Q99666 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
RGPD5Q99666 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC38.91■■■■□ 3.82
RGPD5Q99666 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
RGPD5Q99666 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
RGPD5Q99666 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
RGPD5Q99666 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
RGPD5Q99666 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
RGPD5Q99666 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
RGPD5Q99666 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
RGPD5Q99666 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
RGPD5Q99666 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
RGPD5Q99666 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
RGPD5Q99666 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
RGPD5Q99666 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
RGPD5Q99666 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
RGPD5Q99666 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
RGPD5Q99666 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
RGPD5Q99666 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
RGPD5Q99666 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
RGPD5Q99666 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
RGPD5Q99666 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
RGPD5Q99666 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
RGPD5Q99666 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
RGPD5Q99666 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
RGPD5Q99666 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
RGPD5Q99666 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
RGPD5Q99666 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
RGPD5Q99666 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
RGPD5Q99666 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
RGPD5Q99666 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
RGPD5Q99666 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
RGPD5Q99666 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
RGPD5Q99666 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
RGPD5Q99666 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
RGPD5Q99666 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
RGPD5Q99666 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
RGPD5Q99666 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
RGPD5Q99666 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
RGPD5Q99666 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
RGPD5Q99666 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
RGPD5Q99666 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RGPD5Q99666 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
RGPD5Q99666 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
RGPD5Q99666 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
RGPD5Q99666 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
RGPD5Q99666 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
RGPD5Q99666 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
RGPD5Q99666 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
RGPD5Q99666 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
RGPD5Q99666 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
RGPD5Q99666 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
RGPD5Q99666 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
RGPD5Q99666 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
RGPD5Q99666 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
RGPD5Q99666 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
RGPD5Q99666 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
RGPD5Q99666 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
RGPD5Q99666 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
RGPD5Q99666 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RGPD5Q99666 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
RGPD5Q99666 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
RGPD5Q99666 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
RGPD5Q99666 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RGPD5Q99666 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
RGPD5Q99666 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
RGPD5Q99666 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
RGPD5Q99666 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RGPD5Q99666 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms