Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
UHRF1Q96T88 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
UHRF1Q96T88 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
UHRF1Q96T88 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
UHRF1Q96T88 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
UHRF1Q96T88 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
UHRF1Q96T88 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
UHRF1Q96T88 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
UHRF1Q96T88 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
UHRF1Q96T88 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
UHRF1Q96T88 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
UHRF1Q96T88 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
UHRF1Q96T88 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
UHRF1Q96T88 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
UHRF1Q96T88 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
UHRF1Q96T88 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
UHRF1Q96T88 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
UHRF1Q96T88 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
UHRF1Q96T88 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
UHRF1Q96T88 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
UHRF1Q96T88 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
UHRF1Q96T88 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
UHRF1Q96T88 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
UHRF1Q96T88 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
UHRF1Q96T88 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
UHRF1Q96T88 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
UHRF1Q96T88 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
UHRF1Q96T88 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
UHRF1Q96T88 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
UHRF1Q96T88 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
UHRF1Q96T88 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
UHRF1Q96T88 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
UHRF1Q96T88 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
UHRF1Q96T88 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
UHRF1Q96T88 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
UHRF1Q96T88 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
UHRF1Q96T88 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
UHRF1Q96T88 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
UHRF1Q96T88 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
UHRF1Q96T88 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
UHRF1Q96T88 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
UHRF1Q96T88 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
UHRF1Q96T88 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
UHRF1Q96T88 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
UHRF1Q96T88 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
UHRF1Q96T88 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
UHRF1Q96T88 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
UHRF1Q96T88 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
UHRF1Q96T88 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
UHRF1Q96T88 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
UHRF1Q96T88 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
UHRF1Q96T88 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
UHRF1Q96T88 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
UHRF1Q96T88 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
UHRF1Q96T88 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
UHRF1Q96T88 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
UHRF1Q96T88 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
UHRF1Q96T88 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
UHRF1Q96T88 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
UHRF1Q96T88 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
UHRF1Q96T88 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
UHRF1Q96T88 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
UHRF1Q96T88 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
UHRF1Q96T88 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
UHRF1Q96T88 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
UHRF1Q96T88 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
UHRF1Q96T88 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
UHRF1Q96T88 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
UHRF1Q96T88 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
UHRF1Q96T88 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
UHRF1Q96T88 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
UHRF1Q96T88 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
UHRF1Q96T88 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
UHRF1Q96T88 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
UHRF1Q96T88 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
UHRF1Q96T88 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
UHRF1Q96T88 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
UHRF1Q96T88 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
UHRF1Q96T88 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
UHRF1Q96T88 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
UHRF1Q96T88 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
UHRF1Q96T88 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
UHRF1Q96T88 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
UHRF1Q96T88 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
UHRF1Q96T88 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
UHRF1Q96T88 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
UHRF1Q96T88 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
UHRF1Q96T88 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
UHRF1Q96T88 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
UHRF1Q96T88 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
UHRF1Q96T88 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
UHRF1Q96T88 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
UHRF1Q96T88 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
UHRF1Q96T88 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
UHRF1Q96T88 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
UHRF1Q96T88 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
UHRF1Q96T88 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
UHRF1Q96T88 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
UHRF1Q96T88 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
UHRF1Q96T88 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
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