Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CITED4Q96RK1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CITED4Q96RK1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CITED4Q96RK1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CITED4Q96RK1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CITED4Q96RK1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CITED4Q96RK1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CITED4Q96RK1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CITED4Q96RK1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CITED4Q96RK1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CITED4Q96RK1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CITED4Q96RK1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CITED4Q96RK1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CITED4Q96RK1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CITED4Q96RK1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CITED4Q96RK1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CITED4Q96RK1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CITED4Q96RK1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CITED4Q96RK1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CITED4Q96RK1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CITED4Q96RK1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CITED4Q96RK1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CITED4Q96RK1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CITED4Q96RK1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CITED4Q96RK1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CITED4Q96RK1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CITED4Q96RK1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CITED4Q96RK1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CITED4Q96RK1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CITED4Q96RK1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CITED4Q96RK1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CITED4Q96RK1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CITED4Q96RK1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CITED4Q96RK1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CITED4Q96RK1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CITED4Q96RK1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CITED4Q96RK1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CITED4Q96RK1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CITED4Q96RK1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CITED4Q96RK1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CITED4Q96RK1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CITED4Q96RK1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CITED4Q96RK1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CITED4Q96RK1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CITED4Q96RK1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CITED4Q96RK1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CITED4Q96RK1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CITED4Q96RK1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CITED4Q96RK1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CITED4Q96RK1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CITED4Q96RK1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CITED4Q96RK1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CITED4Q96RK1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CITED4Q96RK1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CITED4Q96RK1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CITED4Q96RK1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CITED4Q96RK1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CITED4Q96RK1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CITED4Q96RK1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CITED4Q96RK1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CITED4Q96RK1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CITED4Q96RK1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CITED4Q96RK1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CITED4Q96RK1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CITED4Q96RK1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CITED4Q96RK1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CITED4Q96RK1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CITED4Q96RK1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CITED4Q96RK1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CITED4Q96RK1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CITED4Q96RK1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CITED4Q96RK1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CITED4Q96RK1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CITED4Q96RK1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CITED4Q96RK1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CITED4Q96RK1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CITED4Q96RK1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CITED4Q96RK1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CITED4Q96RK1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CITED4Q96RK1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CITED4Q96RK1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CITED4Q96RK1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CITED4Q96RK1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CITED4Q96RK1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CITED4Q96RK1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CITED4Q96RK1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CITED4Q96RK1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CITED4Q96RK1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CITED4Q96RK1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CITED4Q96RK1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CITED4Q96RK1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CITED4Q96RK1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CITED4Q96RK1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CITED4Q96RK1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CITED4Q96RK1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CITED4Q96RK1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CITED4Q96RK1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CITED4Q96RK1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CITED4Q96RK1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CITED4Q96RK1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms