Protein–RNA interactions for Protein: Q96NJ6

ZFP3, Zinc finger protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP3Q96NJ6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZFP3Q96NJ6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZFP3Q96NJ6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZFP3Q96NJ6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZFP3Q96NJ6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZFP3Q96NJ6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZFP3Q96NJ6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZFP3Q96NJ6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZFP3Q96NJ6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZFP3Q96NJ6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZFP3Q96NJ6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZFP3Q96NJ6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZFP3Q96NJ6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZFP3Q96NJ6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZFP3Q96NJ6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZFP3Q96NJ6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZFP3Q96NJ6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZFP3Q96NJ6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZFP3Q96NJ6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZFP3Q96NJ6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZFP3Q96NJ6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZFP3Q96NJ6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZFP3Q96NJ6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZFP3Q96NJ6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZFP3Q96NJ6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZFP3Q96NJ6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZFP3Q96NJ6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZFP3Q96NJ6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZFP3Q96NJ6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZFP3Q96NJ6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZFP3Q96NJ6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZFP3Q96NJ6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZFP3Q96NJ6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFP3Q96NJ6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFP3Q96NJ6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFP3Q96NJ6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFP3Q96NJ6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFP3Q96NJ6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFP3Q96NJ6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFP3Q96NJ6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZFP3Q96NJ6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFP3Q96NJ6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFP3Q96NJ6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZFP3Q96NJ6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZFP3Q96NJ6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZFP3Q96NJ6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZFP3Q96NJ6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZFP3Q96NJ6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZFP3Q96NJ6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZFP3Q96NJ6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZFP3Q96NJ6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZFP3Q96NJ6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZFP3Q96NJ6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZFP3Q96NJ6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZFP3Q96NJ6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZFP3Q96NJ6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZFP3Q96NJ6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZFP3Q96NJ6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZFP3Q96NJ6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZFP3Q96NJ6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZFP3Q96NJ6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZFP3Q96NJ6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZFP3Q96NJ6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZFP3Q96NJ6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZFP3Q96NJ6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZFP3Q96NJ6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZFP3Q96NJ6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZFP3Q96NJ6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZFP3Q96NJ6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZFP3Q96NJ6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZFP3Q96NJ6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZFP3Q96NJ6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZFP3Q96NJ6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZFP3Q96NJ6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZFP3Q96NJ6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZFP3Q96NJ6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZFP3Q96NJ6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZFP3Q96NJ6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZFP3Q96NJ6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZFP3Q96NJ6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZFP3Q96NJ6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZFP3Q96NJ6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZFP3Q96NJ6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZFP3Q96NJ6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFP3Q96NJ6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFP3Q96NJ6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFP3Q96NJ6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZFP3Q96NJ6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZFP3Q96NJ6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZFP3Q96NJ6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZFP3Q96NJ6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFP3Q96NJ6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZFP3Q96NJ6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZFP3Q96NJ6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFP3Q96NJ6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFP3Q96NJ6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFP3Q96NJ6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFP3Q96NJ6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFP3Q96NJ6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFP3Q96NJ6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms