Protein–RNA interactions for Protein: Q96N53

LINC00167, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00167, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00167Q96N53 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00167Q96N53 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00167Q96N53 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00167Q96N53 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00167Q96N53 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00167Q96N53 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00167Q96N53 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00167Q96N53 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00167Q96N53 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00167Q96N53 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00167Q96N53 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00167Q96N53 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00167Q96N53 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00167Q96N53 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00167Q96N53 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00167Q96N53 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00167Q96N53 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00167Q96N53 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00167Q96N53 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00167Q96N53 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00167Q96N53 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00167Q96N53 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00167Q96N53 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00167Q96N53 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00167Q96N53 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00167Q96N53 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00167Q96N53 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00167Q96N53 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00167Q96N53 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00167Q96N53 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00167Q96N53 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00167Q96N53 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00167Q96N53 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00167Q96N53 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00167Q96N53 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00167Q96N53 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00167Q96N53 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00167Q96N53 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00167Q96N53 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00167Q96N53 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00167Q96N53 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00167Q96N53 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00167Q96N53 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00167Q96N53 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00167Q96N53 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00167Q96N53 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00167Q96N53 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00167Q96N53 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00167Q96N53 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00167Q96N53 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00167Q96N53 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00167Q96N53 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00167Q96N53 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00167Q96N53 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00167Q96N53 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00167Q96N53 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00167Q96N53 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00167Q96N53 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00167Q96N53 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00167Q96N53 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00167Q96N53 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00167Q96N53 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00167Q96N53 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00167Q96N53 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00167Q96N53 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00167Q96N53 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00167Q96N53 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00167Q96N53 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00167Q96N53 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00167Q96N53 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00167Q96N53 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00167Q96N53 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00167Q96N53 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00167Q96N53 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00167Q96N53 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00167Q96N53 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00167Q96N53 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00167Q96N53 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00167Q96N53 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00167Q96N53 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00167Q96N53 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00167Q96N53 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00167Q96N53 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00167Q96N53 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00167Q96N53 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00167Q96N53 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00167Q96N53 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00167Q96N53 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00167Q96N53 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00167Q96N53 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00167Q96N53 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00167Q96N53 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00167Q96N53 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00167Q96N53 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00167Q96N53 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00167Q96N53 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00167Q96N53 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00167Q96N53 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00167Q96N53 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00167Q96N53 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms