Protein–RNA interactions for Protein: Q96HR3

MED30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED30Q96HR3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED30Q96HR3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED30Q96HR3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED30Q96HR3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED30Q96HR3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED30Q96HR3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED30Q96HR3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED30Q96HR3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED30Q96HR3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED30Q96HR3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED30Q96HR3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MED30Q96HR3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MED30Q96HR3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MED30Q96HR3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MED30Q96HR3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MED30Q96HR3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED30Q96HR3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED30Q96HR3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MED30Q96HR3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MED30Q96HR3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED30Q96HR3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED30Q96HR3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED30Q96HR3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED30Q96HR3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED30Q96HR3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED30Q96HR3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED30Q96HR3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED30Q96HR3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED30Q96HR3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED30Q96HR3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED30Q96HR3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED30Q96HR3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED30Q96HR3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED30Q96HR3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED30Q96HR3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED30Q96HR3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED30Q96HR3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED30Q96HR3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED30Q96HR3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED30Q96HR3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED30Q96HR3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED30Q96HR3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED30Q96HR3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED30Q96HR3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED30Q96HR3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED30Q96HR3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED30Q96HR3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED30Q96HR3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED30Q96HR3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED30Q96HR3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED30Q96HR3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED30Q96HR3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MED30Q96HR3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED30Q96HR3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED30Q96HR3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED30Q96HR3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED30Q96HR3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MED30Q96HR3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MED30Q96HR3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MED30Q96HR3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED30Q96HR3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED30Q96HR3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED30Q96HR3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED30Q96HR3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED30Q96HR3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED30Q96HR3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED30Q96HR3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MED30Q96HR3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED30Q96HR3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED30Q96HR3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MED30Q96HR3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED30Q96HR3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED30Q96HR3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED30Q96HR3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED30Q96HR3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED30Q96HR3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED30Q96HR3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED30Q96HR3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED30Q96HR3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED30Q96HR3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED30Q96HR3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED30Q96HR3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED30Q96HR3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED30Q96HR3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED30Q96HR3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED30Q96HR3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED30Q96HR3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED30Q96HR3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED30Q96HR3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED30Q96HR3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED30Q96HR3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED30Q96HR3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED30Q96HR3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED30Q96HR3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED30Q96HR3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED30Q96HR3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MED30Q96HR3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED30Q96HR3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED30Q96HR3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED30Q96HR3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms