Protein–RNA interactions for Protein: Q96FX7

TRMT61A, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase catalytic subunit TRMT61A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT61AQ96FX7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRMT61AQ96FX7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRMT61AQ96FX7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRMT61AQ96FX7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRMT61AQ96FX7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRMT61AQ96FX7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRMT61AQ96FX7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRMT61AQ96FX7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRMT61AQ96FX7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRMT61AQ96FX7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRMT61AQ96FX7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRMT61AQ96FX7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRMT61AQ96FX7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRMT61AQ96FX7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRMT61AQ96FX7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRMT61AQ96FX7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRMT61AQ96FX7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRMT61AQ96FX7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRMT61AQ96FX7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRMT61AQ96FX7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRMT61AQ96FX7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRMT61AQ96FX7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRMT61AQ96FX7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRMT61AQ96FX7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRMT61AQ96FX7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRMT61AQ96FX7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRMT61AQ96FX7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRMT61AQ96FX7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRMT61AQ96FX7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRMT61AQ96FX7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRMT61AQ96FX7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRMT61AQ96FX7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRMT61AQ96FX7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRMT61AQ96FX7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRMT61AQ96FX7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRMT61AQ96FX7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRMT61AQ96FX7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRMT61AQ96FX7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRMT61AQ96FX7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRMT61AQ96FX7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRMT61AQ96FX7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRMT61AQ96FX7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRMT61AQ96FX7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRMT61AQ96FX7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRMT61AQ96FX7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRMT61AQ96FX7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRMT61AQ96FX7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRMT61AQ96FX7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRMT61AQ96FX7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRMT61AQ96FX7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRMT61AQ96FX7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRMT61AQ96FX7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRMT61AQ96FX7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRMT61AQ96FX7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRMT61AQ96FX7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRMT61AQ96FX7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRMT61AQ96FX7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRMT61AQ96FX7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRMT61AQ96FX7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRMT61AQ96FX7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRMT61AQ96FX7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRMT61AQ96FX7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRMT61AQ96FX7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRMT61AQ96FX7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRMT61AQ96FX7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRMT61AQ96FX7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRMT61AQ96FX7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRMT61AQ96FX7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRMT61AQ96FX7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRMT61AQ96FX7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRMT61AQ96FX7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRMT61AQ96FX7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRMT61AQ96FX7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRMT61AQ96FX7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRMT61AQ96FX7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRMT61AQ96FX7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRMT61AQ96FX7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMT61AQ96FX7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRMT61AQ96FX7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMT61AQ96FX7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMT61AQ96FX7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMT61AQ96FX7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMT61AQ96FX7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMT61AQ96FX7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT61AQ96FX7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT61AQ96FX7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT61AQ96FX7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRMT61AQ96FX7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRMT61AQ96FX7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRMT61AQ96FX7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRMT61AQ96FX7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRMT61AQ96FX7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT61AQ96FX7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT61AQ96FX7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT61AQ96FX7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT61AQ96FX7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRMT61AQ96FX7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT61AQ96FX7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT61AQ96FX7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT61AQ96FX7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms