Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RCN3Q96D15 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RCN3Q96D15 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RCN3Q96D15 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCN3Q96D15 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RCN3Q96D15 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCN3Q96D15 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RCN3Q96D15 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RCN3Q96D15 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RCN3Q96D15 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCN3Q96D15 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCN3Q96D15 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RCN3Q96D15 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RCN3Q96D15 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCN3Q96D15 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCN3Q96D15 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCN3Q96D15 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCN3Q96D15 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCN3Q96D15 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCN3Q96D15 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RCN3Q96D15 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCN3Q96D15 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCN3Q96D15 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCN3Q96D15 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCN3Q96D15 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCN3Q96D15 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCN3Q96D15 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
RCN3Q96D15 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RCN3Q96D15 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCN3Q96D15 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCN3Q96D15 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCN3Q96D15 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCN3Q96D15 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCN3Q96D15 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCN3Q96D15 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RCN3Q96D15 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RCN3Q96D15 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCN3Q96D15 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCN3Q96D15 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCN3Q96D15 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCN3Q96D15 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RCN3Q96D15 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCN3Q96D15 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCN3Q96D15 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCN3Q96D15 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCN3Q96D15 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCN3Q96D15 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCN3Q96D15 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RCN3Q96D15 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RCN3Q96D15 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RCN3Q96D15 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RCN3Q96D15 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RCN3Q96D15 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RCN3Q96D15 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RCN3Q96D15 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RCN3Q96D15 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RCN3Q96D15 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RCN3Q96D15 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCN3Q96D15 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RCN3Q96D15 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RCN3Q96D15 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RCN3Q96D15 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RCN3Q96D15 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCN3Q96D15 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCN3Q96D15 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCN3Q96D15 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCN3Q96D15 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCN3Q96D15 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCN3Q96D15 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCN3Q96D15 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCN3Q96D15 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCN3Q96D15 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCN3Q96D15 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCN3Q96D15 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCN3Q96D15 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCN3Q96D15 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCN3Q96D15 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCN3Q96D15 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCN3Q96D15 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RCN3Q96D15 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCN3Q96D15 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RCN3Q96D15 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RCN3Q96D15 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RCN3Q96D15 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RCN3Q96D15 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RCN3Q96D15 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RCN3Q96D15 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RCN3Q96D15 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RCN3Q96D15 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RCN3Q96D15 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RCN3Q96D15 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RCN3Q96D15 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RCN3Q96D15 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RCN3Q96D15 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RCN3Q96D15 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCN3Q96D15 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCN3Q96D15 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCN3Q96D15 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCN3Q96D15 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCN3Q96D15 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms