Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TOP1MTQ969P6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TOP1MTQ969P6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TOP1MTQ969P6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TOP1MTQ969P6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TOP1MTQ969P6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TOP1MTQ969P6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TOP1MTQ969P6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TOP1MTQ969P6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOP1MTQ969P6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOP1MTQ969P6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOP1MTQ969P6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOP1MTQ969P6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOP1MTQ969P6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TOP1MTQ969P6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOP1MTQ969P6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOP1MTQ969P6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TOP1MTQ969P6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TOP1MTQ969P6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TOP1MTQ969P6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOP1MTQ969P6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TOP1MTQ969P6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TOP1MTQ969P6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TOP1MTQ969P6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TOP1MTQ969P6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TOP1MTQ969P6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TOP1MTQ969P6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TOP1MTQ969P6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TOP1MTQ969P6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TOP1MTQ969P6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TOP1MTQ969P6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TOP1MTQ969P6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TOP1MTQ969P6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TOP1MTQ969P6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TOP1MTQ969P6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
TOP1MTQ969P6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TOP1MTQ969P6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TOP1MTQ969P6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOP1MTQ969P6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TOP1MTQ969P6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
TOP1MTQ969P6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
TOP1MTQ969P6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TOP1MTQ969P6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TOP1MTQ969P6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TOP1MTQ969P6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TOP1MTQ969P6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TOP1MTQ969P6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TOP1MTQ969P6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOP1MTQ969P6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOP1MTQ969P6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
TOP1MTQ969P6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOP1MTQ969P6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOP1MTQ969P6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOP1MTQ969P6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOP1MTQ969P6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOP1MTQ969P6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOP1MTQ969P6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOP1MTQ969P6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOP1MTQ969P6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP1MTQ969P6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP1MTQ969P6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TOP1MTQ969P6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TOP1MTQ969P6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TOP1MTQ969P6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TOP1MTQ969P6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP1MTQ969P6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TOP1MTQ969P6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOP1MTQ969P6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOP1MTQ969P6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOP1MTQ969P6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TOP1MTQ969P6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TOP1MTQ969P6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOP1MTQ969P6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOP1MTQ969P6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TOP1MTQ969P6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
TOP1MTQ969P6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOP1MTQ969P6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOP1MTQ969P6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOP1MTQ969P6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP1MTQ969P6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TOP1MTQ969P6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
TOP1MTQ969P6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOP1MTQ969P6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOP1MTQ969P6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOP1MTQ969P6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TOP1MTQ969P6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP1MTQ969P6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TOP1MTQ969P6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOP1MTQ969P6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TOP1MTQ969P6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TOP1MTQ969P6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TOP1MTQ969P6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TOP1MTQ969P6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TOP1MTQ969P6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
TOP1MTQ969P6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
TOP1MTQ969P6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TOP1MTQ969P6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TOP1MTQ969P6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TOP1MTQ969P6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TOP1MTQ969P6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
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