Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NKD2Q969F2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NKD2Q969F2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NKD2Q969F2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NKD2Q969F2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NKD2Q969F2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NKD2Q969F2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NKD2Q969F2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NKD2Q969F2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NKD2Q969F2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NKD2Q969F2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NKD2Q969F2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NKD2Q969F2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NKD2Q969F2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NKD2Q969F2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NKD2Q969F2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NKD2Q969F2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NKD2Q969F2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NKD2Q969F2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NKD2Q969F2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NKD2Q969F2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NKD2Q969F2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NKD2Q969F2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NKD2Q969F2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NKD2Q969F2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NKD2Q969F2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NKD2Q969F2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
NKD2Q969F2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NKD2Q969F2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NKD2Q969F2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NKD2Q969F2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NKD2Q969F2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NKD2Q969F2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NKD2Q969F2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NKD2Q969F2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NKD2Q969F2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NKD2Q969F2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NKD2Q969F2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NKD2Q969F2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NKD2Q969F2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NKD2Q969F2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NKD2Q969F2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NKD2Q969F2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NKD2Q969F2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NKD2Q969F2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NKD2Q969F2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NKD2Q969F2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NKD2Q969F2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NKD2Q969F2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NKD2Q969F2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NKD2Q969F2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
NKD2Q969F2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NKD2Q969F2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NKD2Q969F2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NKD2Q969F2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NKD2Q969F2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NKD2Q969F2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NKD2Q969F2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NKD2Q969F2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NKD2Q969F2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NKD2Q969F2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NKD2Q969F2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NKD2Q969F2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NKD2Q969F2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NKD2Q969F2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NKD2Q969F2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NKD2Q969F2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NKD2Q969F2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NKD2Q969F2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NKD2Q969F2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NKD2Q969F2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NKD2Q969F2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NKD2Q969F2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NKD2Q969F2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NKD2Q969F2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NKD2Q969F2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NKD2Q969F2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NKD2Q969F2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NKD2Q969F2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NKD2Q969F2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NKD2Q969F2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NKD2Q969F2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NKD2Q969F2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NKD2Q969F2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NKD2Q969F2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NKD2Q969F2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NKD2Q969F2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NKD2Q969F2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NKD2Q969F2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NKD2Q969F2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NKD2Q969F2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NKD2Q969F2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NKD2Q969F2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NKD2Q969F2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NKD2Q969F2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NKD2Q969F2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NKD2Q969F2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NKD2Q969F2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NKD2Q969F2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NKD2Q969F2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms