Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTRA1Q92743 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTRA1Q92743 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTRA1Q92743 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HTRA1Q92743 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HTRA1Q92743 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HTRA1Q92743 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HTRA1Q92743 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTRA1Q92743 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTRA1Q92743 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTRA1Q92743 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTRA1Q92743 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTRA1Q92743 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTRA1Q92743 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTRA1Q92743 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HTRA1Q92743 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HTRA1Q92743 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HTRA1Q92743 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HTRA1Q92743 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HTRA1Q92743 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HTRA1Q92743 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HTRA1Q92743 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HTRA1Q92743 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HTRA1Q92743 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HTRA1Q92743 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HTRA1Q92743 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HTRA1Q92743 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTRA1Q92743 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTRA1Q92743 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTRA1Q92743 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTRA1Q92743 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTRA1Q92743 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTRA1Q92743 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTRA1Q92743 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HTRA1Q92743 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTRA1Q92743 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTRA1Q92743 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTRA1Q92743 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTRA1Q92743 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTRA1Q92743 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTRA1Q92743 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTRA1Q92743 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTRA1Q92743 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTRA1Q92743 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTRA1Q92743 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTRA1Q92743 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTRA1Q92743 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTRA1Q92743 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTRA1Q92743 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTRA1Q92743 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HTRA1Q92743 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTRA1Q92743 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTRA1Q92743 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTRA1Q92743 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTRA1Q92743 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTRA1Q92743 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTRA1Q92743 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTRA1Q92743 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTRA1Q92743 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTRA1Q92743 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTRA1Q92743 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTRA1Q92743 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTRA1Q92743 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HTRA1Q92743 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTRA1Q92743 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTRA1Q92743 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTRA1Q92743 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTRA1Q92743 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HTRA1Q92743 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTRA1Q92743 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTRA1Q92743 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTRA1Q92743 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTRA1Q92743 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTRA1Q92743 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTRA1Q92743 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTRA1Q92743 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTRA1Q92743 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTRA1Q92743 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTRA1Q92743 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HTRA1Q92743 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTRA1Q92743 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTRA1Q92743 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTRA1Q92743 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTRA1Q92743 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HTRA1Q92743 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTRA1Q92743 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTRA1Q92743 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTRA1Q92743 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTRA1Q92743 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTRA1Q92743 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTRA1Q92743 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTRA1Q92743 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTRA1Q92743 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTRA1Q92743 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTRA1Q92743 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HTRA1Q92743 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTRA1Q92743 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTRA1Q92743 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTRA1Q92743 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTRA1Q92743 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms