Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3AQ92664 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3AQ92664 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3AQ92664 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3AQ92664 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3AQ92664 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3AQ92664 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3AQ92664 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3AQ92664 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3AQ92664 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3AQ92664 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF3AQ92664 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3AQ92664 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3AQ92664 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3AQ92664 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3AQ92664 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3AQ92664 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3AQ92664 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3AQ92664 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3AQ92664 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3AQ92664 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF3AQ92664 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3AQ92664 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3AQ92664 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3AQ92664 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3AQ92664 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3AQ92664 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3AQ92664 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3AQ92664 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3AQ92664 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3AQ92664 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3AQ92664 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3AQ92664 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3AQ92664 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3AQ92664 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3AQ92664 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3AQ92664 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3AQ92664 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3AQ92664 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3AQ92664 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3AQ92664 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3AQ92664 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3AQ92664 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3AQ92664 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3AQ92664 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3AQ92664 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3AQ92664 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3AQ92664 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3AQ92664 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3AQ92664 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3AQ92664 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3AQ92664 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3AQ92664 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3AQ92664 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3AQ92664 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3AQ92664 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3AQ92664 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF3AQ92664 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3AQ92664 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3AQ92664 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3AQ92664 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3AQ92664 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3AQ92664 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3AQ92664 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3AQ92664 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3AQ92664 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3AQ92664 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3AQ92664 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3AQ92664 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3AQ92664 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3AQ92664 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF3AQ92664 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3AQ92664 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3AQ92664 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3AQ92664 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3AQ92664 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3AQ92664 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3AQ92664 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3AQ92664 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3AQ92664 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3AQ92664 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF3AQ92664 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3AQ92664 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3AQ92664 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3AQ92664 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3AQ92664 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3AQ92664 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3AQ92664 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3AQ92664 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3AQ92664 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3AQ92664 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3AQ92664 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3AQ92664 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3AQ92664 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3AQ92664 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3AQ92664 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3AQ92664 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3AQ92664 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3AQ92664 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3AQ92664 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms