Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NR4A3Q92570 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NR4A3Q92570 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR4A3Q92570 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR4A3Q92570 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR4A3Q92570 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR4A3Q92570 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR4A3Q92570 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NR4A3Q92570 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR4A3Q92570 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR4A3Q92570 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR4A3Q92570 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR4A3Q92570 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NR4A3Q92570 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NR4A3Q92570 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NR4A3Q92570 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NR4A3Q92570 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NR4A3Q92570 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR4A3Q92570 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR4A3Q92570 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NR4A3Q92570 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NR4A3Q92570 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NR4A3Q92570 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR4A3Q92570 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NR4A3Q92570 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR4A3Q92570 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR4A3Q92570 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NR4A3Q92570 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR4A3Q92570 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR4A3Q92570 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NR4A3Q92570 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR4A3Q92570 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NR4A3Q92570 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NR4A3Q92570 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR4A3Q92570 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR4A3Q92570 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR4A3Q92570 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR4A3Q92570 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NR4A3Q92570 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR4A3Q92570 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR4A3Q92570 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR4A3Q92570 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR4A3Q92570 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR4A3Q92570 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR4A3Q92570 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR4A3Q92570 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR4A3Q92570 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR4A3Q92570 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR4A3Q92570 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR4A3Q92570 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR4A3Q92570 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NR4A3Q92570 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR4A3Q92570 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR4A3Q92570 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR4A3Q92570 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR4A3Q92570 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR4A3Q92570 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR4A3Q92570 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR4A3Q92570 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR4A3Q92570 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR4A3Q92570 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR4A3Q92570 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR4A3Q92570 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR4A3Q92570 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR4A3Q92570 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR4A3Q92570 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR4A3Q92570 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR4A3Q92570 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR4A3Q92570 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR4A3Q92570 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR4A3Q92570 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR4A3Q92570 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR4A3Q92570 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR4A3Q92570 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR4A3Q92570 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR4A3Q92570 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR4A3Q92570 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR4A3Q92570 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR4A3Q92570 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR4A3Q92570 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR4A3Q92570 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NR4A3Q92570 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR4A3Q92570 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NR4A3Q92570 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR4A3Q92570 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR4A3Q92570 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR4A3Q92570 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR4A3Q92570 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR4A3Q92570 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR4A3Q92570 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR4A3Q92570 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR4A3Q92570 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR4A3Q92570 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR4A3Q92570 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR4A3Q92570 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR4A3Q92570 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR4A3Q92570 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR4A3Q92570 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR4A3Q92570 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR4A3Q92570 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms