Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
STAG1Q8WVM7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
STAG1Q8WVM7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
STAG1Q8WVM7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
STAG1Q8WVM7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
STAG1Q8WVM7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
STAG1Q8WVM7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
STAG1Q8WVM7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
STAG1Q8WVM7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
STAG1Q8WVM7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
STAG1Q8WVM7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
STAG1Q8WVM7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
STAG1Q8WVM7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
STAG1Q8WVM7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
STAG1Q8WVM7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
STAG1Q8WVM7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
STAG1Q8WVM7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
STAG1Q8WVM7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
STAG1Q8WVM7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
STAG1Q8WVM7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
STAG1Q8WVM7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
STAG1Q8WVM7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
STAG1Q8WVM7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
STAG1Q8WVM7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
STAG1Q8WVM7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
STAG1Q8WVM7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
STAG1Q8WVM7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
STAG1Q8WVM7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
STAG1Q8WVM7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
STAG1Q8WVM7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
STAG1Q8WVM7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
STAG1Q8WVM7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
STAG1Q8WVM7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
STAG1Q8WVM7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
STAG1Q8WVM7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
STAG1Q8WVM7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
STAG1Q8WVM7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
STAG1Q8WVM7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
STAG1Q8WVM7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
STAG1Q8WVM7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
STAG1Q8WVM7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.81■■■■□ 3
STAG1Q8WVM7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
STAG1Q8WVM7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
STAG1Q8WVM7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
STAG1Q8WVM7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
STAG1Q8WVM7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
STAG1Q8WVM7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
STAG1Q8WVM7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
STAG1Q8WVM7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
STAG1Q8WVM7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
STAG1Q8WVM7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
STAG1Q8WVM7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
STAG1Q8WVM7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
STAG1Q8WVM7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
STAG1Q8WVM7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
STAG1Q8WVM7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
STAG1Q8WVM7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
STAG1Q8WVM7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
STAG1Q8WVM7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
STAG1Q8WVM7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
STAG1Q8WVM7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
STAG1Q8WVM7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
STAG1Q8WVM7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
STAG1Q8WVM7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
STAG1Q8WVM7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
STAG1Q8WVM7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
STAG1Q8WVM7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
STAG1Q8WVM7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
STAG1Q8WVM7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
STAG1Q8WVM7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
STAG1Q8WVM7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
STAG1Q8WVM7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
STAG1Q8WVM7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
STAG1Q8WVM7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
STAG1Q8WVM7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
STAG1Q8WVM7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
STAG1Q8WVM7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
STAG1Q8WVM7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
STAG1Q8WVM7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
STAG1Q8WVM7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
STAG1Q8WVM7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
STAG1Q8WVM7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
STAG1Q8WVM7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
STAG1Q8WVM7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
STAG1Q8WVM7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
STAG1Q8WVM7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
STAG1Q8WVM7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
STAG1Q8WVM7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
STAG1Q8WVM7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
STAG1Q8WVM7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
STAG1Q8WVM7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
STAG1Q8WVM7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
STAG1Q8WVM7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
STAG1Q8WVM7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
STAG1Q8WVM7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
STAG1Q8WVM7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
STAG1Q8WVM7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
STAG1Q8WVM7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
STAG1Q8WVM7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
STAG1Q8WVM7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms