Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHD5Q8TDI0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHD5Q8TDI0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHD5Q8TDI0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHD5Q8TDI0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHD5Q8TDI0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHD5Q8TDI0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHD5Q8TDI0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHD5Q8TDI0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHD5Q8TDI0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHD5Q8TDI0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHD5Q8TDI0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHD5Q8TDI0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHD5Q8TDI0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHD5Q8TDI0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHD5Q8TDI0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHD5Q8TDI0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHD5Q8TDI0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHD5Q8TDI0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHD5Q8TDI0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHD5Q8TDI0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHD5Q8TDI0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHD5Q8TDI0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CHD5Q8TDI0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHD5Q8TDI0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHD5Q8TDI0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHD5Q8TDI0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHD5Q8TDI0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHD5Q8TDI0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHD5Q8TDI0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHD5Q8TDI0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHD5Q8TDI0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHD5Q8TDI0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHD5Q8TDI0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHD5Q8TDI0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHD5Q8TDI0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHD5Q8TDI0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHD5Q8TDI0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHD5Q8TDI0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHD5Q8TDI0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CHD5Q8TDI0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHD5Q8TDI0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHD5Q8TDI0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHD5Q8TDI0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHD5Q8TDI0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHD5Q8TDI0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHD5Q8TDI0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHD5Q8TDI0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CHD5Q8TDI0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHD5Q8TDI0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHD5Q8TDI0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHD5Q8TDI0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHD5Q8TDI0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHD5Q8TDI0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHD5Q8TDI0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHD5Q8TDI0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHD5Q8TDI0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHD5Q8TDI0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHD5Q8TDI0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHD5Q8TDI0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHD5Q8TDI0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHD5Q8TDI0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHD5Q8TDI0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHD5Q8TDI0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHD5Q8TDI0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHD5Q8TDI0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHD5Q8TDI0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHD5Q8TDI0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHD5Q8TDI0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHD5Q8TDI0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHD5Q8TDI0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHD5Q8TDI0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHD5Q8TDI0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHD5Q8TDI0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHD5Q8TDI0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHD5Q8TDI0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHD5Q8TDI0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHD5Q8TDI0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHD5Q8TDI0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHD5Q8TDI0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHD5Q8TDI0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHD5Q8TDI0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHD5Q8TDI0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHD5Q8TDI0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHD5Q8TDI0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHD5Q8TDI0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHD5Q8TDI0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHD5Q8TDI0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHD5Q8TDI0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHD5Q8TDI0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHD5Q8TDI0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHD5Q8TDI0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHD5Q8TDI0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHD5Q8TDI0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHD5Q8TDI0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHD5Q8TDI0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHD5Q8TDI0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHD5Q8TDI0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHD5Q8TDI0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CHD5Q8TDI0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms