Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAB3IL1Q8TBN0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB3IL1Q8TBN0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB3IL1Q8TBN0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB3IL1Q8TBN0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB3IL1Q8TBN0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB3IL1Q8TBN0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB3IL1Q8TBN0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB3IL1Q8TBN0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB3IL1Q8TBN0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB3IL1Q8TBN0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB3IL1Q8TBN0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAB3IL1Q8TBN0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB3IL1Q8TBN0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB3IL1Q8TBN0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB3IL1Q8TBN0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB3IL1Q8TBN0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB3IL1Q8TBN0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB3IL1Q8TBN0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB3IL1Q8TBN0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB3IL1Q8TBN0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAB3IL1Q8TBN0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAB3IL1Q8TBN0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB3IL1Q8TBN0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB3IL1Q8TBN0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB3IL1Q8TBN0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB3IL1Q8TBN0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB3IL1Q8TBN0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB3IL1Q8TBN0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB3IL1Q8TBN0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB3IL1Q8TBN0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB3IL1Q8TBN0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB3IL1Q8TBN0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB3IL1Q8TBN0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB3IL1Q8TBN0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB3IL1Q8TBN0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB3IL1Q8TBN0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RAB3IL1Q8TBN0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB3IL1Q8TBN0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB3IL1Q8TBN0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB3IL1Q8TBN0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB3IL1Q8TBN0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB3IL1Q8TBN0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAB3IL1Q8TBN0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAB3IL1Q8TBN0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB3IL1Q8TBN0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RAB3IL1Q8TBN0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB3IL1Q8TBN0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB3IL1Q8TBN0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB3IL1Q8TBN0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB3IL1Q8TBN0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB3IL1Q8TBN0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB3IL1Q8TBN0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB3IL1Q8TBN0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB3IL1Q8TBN0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB3IL1Q8TBN0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB3IL1Q8TBN0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB3IL1Q8TBN0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB3IL1Q8TBN0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAB3IL1Q8TBN0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAB3IL1Q8TBN0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAB3IL1Q8TBN0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAB3IL1Q8TBN0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAB3IL1Q8TBN0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB3IL1Q8TBN0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB3IL1Q8TBN0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB3IL1Q8TBN0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB3IL1Q8TBN0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB3IL1Q8TBN0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB3IL1Q8TBN0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB3IL1Q8TBN0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB3IL1Q8TBN0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB3IL1Q8TBN0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB3IL1Q8TBN0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB3IL1Q8TBN0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB3IL1Q8TBN0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB3IL1Q8TBN0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB3IL1Q8TBN0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB3IL1Q8TBN0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB3IL1Q8TBN0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB3IL1Q8TBN0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB3IL1Q8TBN0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB3IL1Q8TBN0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB3IL1Q8TBN0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB3IL1Q8TBN0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB3IL1Q8TBN0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB3IL1Q8TBN0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB3IL1Q8TBN0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB3IL1Q8TBN0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB3IL1Q8TBN0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB3IL1Q8TBN0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB3IL1Q8TBN0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB3IL1Q8TBN0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB3IL1Q8TBN0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB3IL1Q8TBN0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB3IL1Q8TBN0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB3IL1Q8TBN0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB3IL1Q8TBN0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB3IL1Q8TBN0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB3IL1Q8TBN0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms