Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DTX3Q8N9I9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DTX3Q8N9I9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DTX3Q8N9I9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DTX3Q8N9I9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DTX3Q8N9I9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DTX3Q8N9I9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DTX3Q8N9I9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DTX3Q8N9I9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DTX3Q8N9I9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DTX3Q8N9I9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DTX3Q8N9I9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DTX3Q8N9I9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DTX3Q8N9I9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DTX3Q8N9I9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DTX3Q8N9I9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DTX3Q8N9I9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DTX3Q8N9I9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DTX3Q8N9I9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DTX3Q8N9I9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DTX3Q8N9I9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DTX3Q8N9I9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DTX3Q8N9I9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DTX3Q8N9I9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DTX3Q8N9I9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DTX3Q8N9I9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DTX3Q8N9I9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DTX3Q8N9I9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DTX3Q8N9I9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DTX3Q8N9I9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DTX3Q8N9I9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DTX3Q8N9I9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DTX3Q8N9I9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DTX3Q8N9I9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DTX3Q8N9I9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DTX3Q8N9I9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DTX3Q8N9I9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DTX3Q8N9I9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DTX3Q8N9I9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DTX3Q8N9I9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DTX3Q8N9I9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DTX3Q8N9I9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DTX3Q8N9I9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DTX3Q8N9I9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DTX3Q8N9I9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DTX3Q8N9I9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DTX3Q8N9I9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DTX3Q8N9I9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DTX3Q8N9I9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DTX3Q8N9I9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DTX3Q8N9I9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DTX3Q8N9I9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DTX3Q8N9I9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DTX3Q8N9I9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DTX3Q8N9I9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DTX3Q8N9I9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DTX3Q8N9I9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DTX3Q8N9I9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DTX3Q8N9I9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DTX3Q8N9I9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DTX3Q8N9I9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DTX3Q8N9I9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DTX3Q8N9I9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DTX3Q8N9I9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DTX3Q8N9I9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DTX3Q8N9I9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DTX3Q8N9I9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DTX3Q8N9I9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DTX3Q8N9I9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DTX3Q8N9I9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DTX3Q8N9I9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DTX3Q8N9I9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DTX3Q8N9I9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DTX3Q8N9I9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DTX3Q8N9I9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DTX3Q8N9I9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DTX3Q8N9I9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DTX3Q8N9I9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DTX3Q8N9I9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DTX3Q8N9I9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DTX3Q8N9I9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DTX3Q8N9I9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DTX3Q8N9I9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DTX3Q8N9I9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DTX3Q8N9I9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DTX3Q8N9I9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DTX3Q8N9I9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DTX3Q8N9I9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DTX3Q8N9I9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DTX3Q8N9I9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DTX3Q8N9I9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DTX3Q8N9I9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DTX3Q8N9I9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DTX3Q8N9I9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DTX3Q8N9I9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DTX3Q8N9I9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DTX3Q8N9I9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DTX3Q8N9I9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DTX3Q8N9I9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DTX3Q8N9I9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms