Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B5

JMY, Junction-mediating and -regulatory protein, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMYQ8N9B5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
JMYQ8N9B5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
JMYQ8N9B5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
JMYQ8N9B5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
JMYQ8N9B5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
JMYQ8N9B5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
JMYQ8N9B5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
JMYQ8N9B5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
JMYQ8N9B5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
JMYQ8N9B5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
JMYQ8N9B5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
JMYQ8N9B5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
JMYQ8N9B5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
JMYQ8N9B5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
JMYQ8N9B5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
JMYQ8N9B5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
JMYQ8N9B5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
JMYQ8N9B5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
JMYQ8N9B5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
JMYQ8N9B5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
JMYQ8N9B5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC35.29■■■■□ 3.24
JMYQ8N9B5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
JMYQ8N9B5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
JMYQ8N9B5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
JMYQ8N9B5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
JMYQ8N9B5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
JMYQ8N9B5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
JMYQ8N9B5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
JMYQ8N9B5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
JMYQ8N9B5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
JMYQ8N9B5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
JMYQ8N9B5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
JMYQ8N9B5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
JMYQ8N9B5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
JMYQ8N9B5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
JMYQ8N9B5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
JMYQ8N9B5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
JMYQ8N9B5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
JMYQ8N9B5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
JMYQ8N9B5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
JMYQ8N9B5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
JMYQ8N9B5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
JMYQ8N9B5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
JMYQ8N9B5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
JMYQ8N9B5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
JMYQ8N9B5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
JMYQ8N9B5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
JMYQ8N9B5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
JMYQ8N9B5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
JMYQ8N9B5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
JMYQ8N9B5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
JMYQ8N9B5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
JMYQ8N9B5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
JMYQ8N9B5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
JMYQ8N9B5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
JMYQ8N9B5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
JMYQ8N9B5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
JMYQ8N9B5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
JMYQ8N9B5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
JMYQ8N9B5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
JMYQ8N9B5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
JMYQ8N9B5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
JMYQ8N9B5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
JMYQ8N9B5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
JMYQ8N9B5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
JMYQ8N9B5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
JMYQ8N9B5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
JMYQ8N9B5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
JMYQ8N9B5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
JMYQ8N9B5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
JMYQ8N9B5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
JMYQ8N9B5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
JMYQ8N9B5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
JMYQ8N9B5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
JMYQ8N9B5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
JMYQ8N9B5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
JMYQ8N9B5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
JMYQ8N9B5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
JMYQ8N9B5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
JMYQ8N9B5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
JMYQ8N9B5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
JMYQ8N9B5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
JMYQ8N9B5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
JMYQ8N9B5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
JMYQ8N9B5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
JMYQ8N9B5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
JMYQ8N9B5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
JMYQ8N9B5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
JMYQ8N9B5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
JMYQ8N9B5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
JMYQ8N9B5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
JMYQ8N9B5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
JMYQ8N9B5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
JMYQ8N9B5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
JMYQ8N9B5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
JMYQ8N9B5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
JMYQ8N9B5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
JMYQ8N9B5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
JMYQ8N9B5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
JMYQ8N9B5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms