Protein–RNA interactions for Protein: Q8N668

COMMD1, COMM domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD1Q8N668 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COMMD1Q8N668 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COMMD1Q8N668 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
COMMD1Q8N668 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COMMD1Q8N668 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COMMD1Q8N668 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COMMD1Q8N668 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COMMD1Q8N668 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COMMD1Q8N668 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COMMD1Q8N668 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COMMD1Q8N668 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COMMD1Q8N668 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COMMD1Q8N668 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COMMD1Q8N668 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COMMD1Q8N668 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COMMD1Q8N668 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COMMD1Q8N668 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COMMD1Q8N668 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COMMD1Q8N668 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COMMD1Q8N668 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COMMD1Q8N668 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COMMD1Q8N668 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COMMD1Q8N668 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COMMD1Q8N668 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COMMD1Q8N668 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COMMD1Q8N668 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COMMD1Q8N668 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COMMD1Q8N668 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COMMD1Q8N668 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COMMD1Q8N668 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COMMD1Q8N668 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COMMD1Q8N668 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COMMD1Q8N668 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COMMD1Q8N668 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COMMD1Q8N668 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COMMD1Q8N668 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COMMD1Q8N668 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COMMD1Q8N668 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COMMD1Q8N668 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COMMD1Q8N668 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COMMD1Q8N668 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COMMD1Q8N668 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COMMD1Q8N668 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COMMD1Q8N668 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COMMD1Q8N668 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COMMD1Q8N668 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COMMD1Q8N668 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COMMD1Q8N668 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COMMD1Q8N668 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COMMD1Q8N668 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COMMD1Q8N668 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COMMD1Q8N668 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COMMD1Q8N668 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COMMD1Q8N668 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COMMD1Q8N668 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COMMD1Q8N668 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COMMD1Q8N668 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COMMD1Q8N668 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COMMD1Q8N668 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COMMD1Q8N668 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COMMD1Q8N668 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COMMD1Q8N668 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COMMD1Q8N668 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COMMD1Q8N668 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COMMD1Q8N668 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COMMD1Q8N668 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD1Q8N668 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD1Q8N668 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD1Q8N668 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COMMD1Q8N668 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD1Q8N668 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD1Q8N668 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD1Q8N668 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD1Q8N668 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COMMD1Q8N668 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD1Q8N668 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD1Q8N668 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD1Q8N668 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COMMD1Q8N668 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COMMD1Q8N668 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD1Q8N668 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COMMD1Q8N668 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COMMD1Q8N668 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD1Q8N668 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD1Q8N668 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD1Q8N668 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COMMD1Q8N668 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COMMD1Q8N668 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COMMD1Q8N668 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COMMD1Q8N668 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COMMD1Q8N668 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COMMD1Q8N668 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD1Q8N668 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD1Q8N668 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD1Q8N668 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD1Q8N668 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD1Q8N668 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD1Q8N668 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD1Q8N668 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD1Q8N668 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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