Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SFRP1Q8N474 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SFRP1Q8N474 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SFRP1Q8N474 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SFRP1Q8N474 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SFRP1Q8N474 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SFRP1Q8N474 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SFRP1Q8N474 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SFRP1Q8N474 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SFRP1Q8N474 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SFRP1Q8N474 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SFRP1Q8N474 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SFRP1Q8N474 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SFRP1Q8N474 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SFRP1Q8N474 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SFRP1Q8N474 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SFRP1Q8N474 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SFRP1Q8N474 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SFRP1Q8N474 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SFRP1Q8N474 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SFRP1Q8N474 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SFRP1Q8N474 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SFRP1Q8N474 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SFRP1Q8N474 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SFRP1Q8N474 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SFRP1Q8N474 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SFRP1Q8N474 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SFRP1Q8N474 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SFRP1Q8N474 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SFRP1Q8N474 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SFRP1Q8N474 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SFRP1Q8N474 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SFRP1Q8N474 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SFRP1Q8N474 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SFRP1Q8N474 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SFRP1Q8N474 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SFRP1Q8N474 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SFRP1Q8N474 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SFRP1Q8N474 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SFRP1Q8N474 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SFRP1Q8N474 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SFRP1Q8N474 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SFRP1Q8N474 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SFRP1Q8N474 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SFRP1Q8N474 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SFRP1Q8N474 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SFRP1Q8N474 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SFRP1Q8N474 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SFRP1Q8N474 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SFRP1Q8N474 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SFRP1Q8N474 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SFRP1Q8N474 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SFRP1Q8N474 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SFRP1Q8N474 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SFRP1Q8N474 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SFRP1Q8N474 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SFRP1Q8N474 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SFRP1Q8N474 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SFRP1Q8N474 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SFRP1Q8N474 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SFRP1Q8N474 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SFRP1Q8N474 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SFRP1Q8N474 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SFRP1Q8N474 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SFRP1Q8N474 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SFRP1Q8N474 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SFRP1Q8N474 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SFRP1Q8N474 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SFRP1Q8N474 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SFRP1Q8N474 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SFRP1Q8N474 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SFRP1Q8N474 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SFRP1Q8N474 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SFRP1Q8N474 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SFRP1Q8N474 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SFRP1Q8N474 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SFRP1Q8N474 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SFRP1Q8N474 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SFRP1Q8N474 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SFRP1Q8N474 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SFRP1Q8N474 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SFRP1Q8N474 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SFRP1Q8N474 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SFRP1Q8N474 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SFRP1Q8N474 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SFRP1Q8N474 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFRP1Q8N474 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SFRP1Q8N474 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SFRP1Q8N474 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SFRP1Q8N474 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SFRP1Q8N474 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SFRP1Q8N474 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SFRP1Q8N474 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SFRP1Q8N474 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SFRP1Q8N474 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SFRP1Q8N474 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SFRP1Q8N474 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SFRP1Q8N474 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SFRP1Q8N474 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SFRP1Q8N474 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms