Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1C3

GABRG1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG1Q8N1C3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABRG1Q8N1C3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABRG1Q8N1C3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRG1Q8N1C3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRG1Q8N1C3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRG1Q8N1C3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRG1Q8N1C3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABRG1Q8N1C3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABRG1Q8N1C3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABRG1Q8N1C3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GABRG1Q8N1C3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABRG1Q8N1C3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABRG1Q8N1C3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRG1Q8N1C3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRG1Q8N1C3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABRG1Q8N1C3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABRG1Q8N1C3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABRG1Q8N1C3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABRG1Q8N1C3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABRG1Q8N1C3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABRG1Q8N1C3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABRG1Q8N1C3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABRG1Q8N1C3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABRG1Q8N1C3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRG1Q8N1C3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABRG1Q8N1C3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRG1Q8N1C3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRG1Q8N1C3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRG1Q8N1C3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRG1Q8N1C3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRG1Q8N1C3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRG1Q8N1C3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRG1Q8N1C3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRG1Q8N1C3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GABRG1Q8N1C3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRG1Q8N1C3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRG1Q8N1C3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRG1Q8N1C3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRG1Q8N1C3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRG1Q8N1C3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRG1Q8N1C3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRG1Q8N1C3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRG1Q8N1C3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRG1Q8N1C3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRG1Q8N1C3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRG1Q8N1C3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABRG1Q8N1C3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABRG1Q8N1C3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GABRG1Q8N1C3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABRG1Q8N1C3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRG1Q8N1C3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRG1Q8N1C3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABRG1Q8N1C3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABRG1Q8N1C3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRG1Q8N1C3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRG1Q8N1C3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GABRG1Q8N1C3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRG1Q8N1C3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRG1Q8N1C3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRG1Q8N1C3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRG1Q8N1C3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRG1Q8N1C3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABRG1Q8N1C3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABRG1Q8N1C3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRG1Q8N1C3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRG1Q8N1C3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRG1Q8N1C3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRG1Q8N1C3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRG1Q8N1C3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRG1Q8N1C3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRG1Q8N1C3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRG1Q8N1C3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRG1Q8N1C3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRG1Q8N1C3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRG1Q8N1C3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRG1Q8N1C3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRG1Q8N1C3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRG1Q8N1C3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRG1Q8N1C3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRG1Q8N1C3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRG1Q8N1C3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRG1Q8N1C3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRG1Q8N1C3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRG1Q8N1C3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRG1Q8N1C3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRG1Q8N1C3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRG1Q8N1C3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABRG1Q8N1C3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GABRG1Q8N1C3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GABRG1Q8N1C3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRG1Q8N1C3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRG1Q8N1C3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRG1Q8N1C3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRG1Q8N1C3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRG1Q8N1C3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRG1Q8N1C3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRG1Q8N1C3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRG1Q8N1C3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRG1Q8N1C3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRG1Q8N1C3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms