Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CACNA2D3Q8IZS8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CACNA2D3Q8IZS8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CACNA2D3Q8IZS8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CACNA2D3Q8IZS8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CACNA2D3Q8IZS8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CACNA2D3Q8IZS8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNA2D3Q8IZS8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNA2D3Q8IZS8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CACNA2D3Q8IZS8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CACNA2D3Q8IZS8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CACNA2D3Q8IZS8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CACNA2D3Q8IZS8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CACNA2D3Q8IZS8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CACNA2D3Q8IZS8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CACNA2D3Q8IZS8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CACNA2D3Q8IZS8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CACNA2D3Q8IZS8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CACNA2D3Q8IZS8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CACNA2D3Q8IZS8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CACNA2D3Q8IZS8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CACNA2D3Q8IZS8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CACNA2D3Q8IZS8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNA2D3Q8IZS8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNA2D3Q8IZS8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CACNA2D3Q8IZS8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CACNA2D3Q8IZS8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CACNA2D3Q8IZS8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNA2D3Q8IZS8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA2D3Q8IZS8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CACNA2D3Q8IZS8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CACNA2D3Q8IZS8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CACNA2D3Q8IZS8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CACNA2D3Q8IZS8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNA2D3Q8IZS8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNA2D3Q8IZS8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNA2D3Q8IZS8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNA2D3Q8IZS8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNA2D3Q8IZS8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNA2D3Q8IZS8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CACNA2D3Q8IZS8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CACNA2D3Q8IZS8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CACNA2D3Q8IZS8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CACNA2D3Q8IZS8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CACNA2D3Q8IZS8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNA2D3Q8IZS8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CACNA2D3Q8IZS8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CACNA2D3Q8IZS8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CACNA2D3Q8IZS8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CACNA2D3Q8IZS8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNA2D3Q8IZS8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNA2D3Q8IZS8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNA2D3Q8IZS8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNA2D3Q8IZS8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNA2D3Q8IZS8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNA2D3Q8IZS8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNA2D3Q8IZS8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CACNA2D3Q8IZS8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CACNA2D3Q8IZS8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CACNA2D3Q8IZS8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNA2D3Q8IZS8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA2D3Q8IZS8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA2D3Q8IZS8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNA2D3Q8IZS8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNA2D3Q8IZS8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNA2D3Q8IZS8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CACNA2D3Q8IZS8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNA2D3Q8IZS8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNA2D3Q8IZS8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNA2D3Q8IZS8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNA2D3Q8IZS8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNA2D3Q8IZS8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNA2D3Q8IZS8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNA2D3Q8IZS8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNA2D3Q8IZS8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CACNA2D3Q8IZS8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNA2D3Q8IZS8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA2D3Q8IZS8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA2D3Q8IZS8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNA2D3Q8IZS8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNA2D3Q8IZS8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNA2D3Q8IZS8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNA2D3Q8IZS8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNA2D3Q8IZS8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNA2D3Q8IZS8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNA2D3Q8IZS8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA2D3Q8IZS8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA2D3Q8IZS8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA2D3Q8IZS8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA2D3Q8IZS8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA2D3Q8IZS8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNA2D3Q8IZS8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNA2D3Q8IZS8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNA2D3Q8IZS8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNA2D3Q8IZS8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNA2D3Q8IZS8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNA2D3Q8IZS8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNA2D3Q8IZS8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNA2D3Q8IZS8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms