Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ4

GPALPP1, GPALPP motifs-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPALPP1Q8IXQ4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPALPP1Q8IXQ4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPALPP1Q8IXQ4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPALPP1Q8IXQ4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPALPP1Q8IXQ4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPALPP1Q8IXQ4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPALPP1Q8IXQ4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPALPP1Q8IXQ4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPALPP1Q8IXQ4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPALPP1Q8IXQ4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPALPP1Q8IXQ4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPALPP1Q8IXQ4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPALPP1Q8IXQ4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPALPP1Q8IXQ4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPALPP1Q8IXQ4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPALPP1Q8IXQ4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPALPP1Q8IXQ4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPALPP1Q8IXQ4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GPALPP1Q8IXQ4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPALPP1Q8IXQ4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPALPP1Q8IXQ4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPALPP1Q8IXQ4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPALPP1Q8IXQ4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPALPP1Q8IXQ4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPALPP1Q8IXQ4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPALPP1Q8IXQ4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPALPP1Q8IXQ4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPALPP1Q8IXQ4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPALPP1Q8IXQ4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPALPP1Q8IXQ4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPALPP1Q8IXQ4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPALPP1Q8IXQ4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GPALPP1Q8IXQ4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GPALPP1Q8IXQ4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPALPP1Q8IXQ4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPALPP1Q8IXQ4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPALPP1Q8IXQ4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPALPP1Q8IXQ4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPALPP1Q8IXQ4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPALPP1Q8IXQ4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPALPP1Q8IXQ4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPALPP1Q8IXQ4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPALPP1Q8IXQ4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPALPP1Q8IXQ4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPALPP1Q8IXQ4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPALPP1Q8IXQ4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPALPP1Q8IXQ4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPALPP1Q8IXQ4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPALPP1Q8IXQ4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPALPP1Q8IXQ4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPALPP1Q8IXQ4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPALPP1Q8IXQ4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPALPP1Q8IXQ4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPALPP1Q8IXQ4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPALPP1Q8IXQ4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPALPP1Q8IXQ4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPALPP1Q8IXQ4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPALPP1Q8IXQ4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPALPP1Q8IXQ4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPALPP1Q8IXQ4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPALPP1Q8IXQ4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPALPP1Q8IXQ4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPALPP1Q8IXQ4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPALPP1Q8IXQ4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPALPP1Q8IXQ4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPALPP1Q8IXQ4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPALPP1Q8IXQ4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPALPP1Q8IXQ4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPALPP1Q8IXQ4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPALPP1Q8IXQ4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GPALPP1Q8IXQ4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
GPALPP1Q8IXQ4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GPALPP1Q8IXQ4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GPALPP1Q8IXQ4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPALPP1Q8IXQ4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPALPP1Q8IXQ4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPALPP1Q8IXQ4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPALPP1Q8IXQ4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPALPP1Q8IXQ4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPALPP1Q8IXQ4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPALPP1Q8IXQ4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GPALPP1Q8IXQ4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPALPP1Q8IXQ4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPALPP1Q8IXQ4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPALPP1Q8IXQ4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPALPP1Q8IXQ4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPALPP1Q8IXQ4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPALPP1Q8IXQ4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPALPP1Q8IXQ4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPALPP1Q8IXQ4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPALPP1Q8IXQ4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPALPP1Q8IXQ4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPALPP1Q8IXQ4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPALPP1Q8IXQ4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPALPP1Q8IXQ4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPALPP1Q8IXQ4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPALPP1Q8IXQ4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPALPP1Q8IXQ4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPALPP1Q8IXQ4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPALPP1Q8IXQ4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms